Protein–RNA interactions for Protein: Q64523

Hist2h2ac, Histone H2A type 2-C, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hist2h2acQ64523 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hist2h2acQ64523 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hist2h2acQ64523 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hist2h2acQ64523 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hist2h2acQ64523 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hist2h2acQ64523 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hist2h2acQ64523 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hist2h2acQ64523 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hist2h2acQ64523 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hist2h2acQ64523 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hist2h2acQ64523 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hist2h2acQ64523 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hist2h2acQ64523 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hist2h2acQ64523 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hist2h2acQ64523 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Hist2h2acQ64523 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hist2h2acQ64523 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hist2h2acQ64523 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hist2h2acQ64523 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hist2h2acQ64523 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hist2h2acQ64523 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hist2h2acQ64523 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hist2h2acQ64523 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hist2h2acQ64523 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hist2h2acQ64523 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hist2h2acQ64523 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hist2h2acQ64523 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hist2h2acQ64523 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hist2h2acQ64523 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hist2h2acQ64523 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hist2h2acQ64523 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23■■□□□ 1.27
Hist2h2acQ64523 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hist2h2acQ64523 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hist2h2acQ64523 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hist2h2acQ64523 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hist2h2acQ64523 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hist2h2acQ64523 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hist2h2acQ64523 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hist2h2acQ64523 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hist2h2acQ64523 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hist2h2acQ64523 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hist2h2acQ64523 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hist2h2acQ64523 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hist2h2acQ64523 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hist2h2acQ64523 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hist2h2acQ64523 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hist2h2acQ64523 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hist2h2acQ64523 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hist2h2acQ64523 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hist2h2acQ64523 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hist2h2acQ64523 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hist2h2acQ64523 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hist2h2acQ64523 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hist2h2acQ64523 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hist2h2acQ64523 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hist2h2acQ64523 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hist2h2acQ64523 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hist2h2acQ64523 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hist2h2acQ64523 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hist2h2acQ64523 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hist2h2acQ64523 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hist2h2acQ64523 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Hist2h2acQ64523 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Hist2h2acQ64523 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Hist2h2acQ64523 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Hist2h2acQ64523 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Hist2h2acQ64523 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hist2h2acQ64523 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hist2h2acQ64523 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hist2h2acQ64523 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hist2h2acQ64523 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hist2h2acQ64523 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hist2h2acQ64523 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hist2h2acQ64523 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hist2h2acQ64523 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hist2h2acQ64523 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hist2h2acQ64523 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hist2h2acQ64523 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hist2h2acQ64523 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hist2h2acQ64523 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hist2h2acQ64523 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hist2h2acQ64523 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hist2h2acQ64523 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hist2h2acQ64523 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hist2h2acQ64523 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hist2h2acQ64523 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hist2h2acQ64523 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hist2h2acQ64523 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hist2h2acQ64523 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Hist2h2acQ64523 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Hist2h2acQ64523 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hist2h2acQ64523 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hist2h2acQ64523 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hist2h2acQ64523 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hist2h2acQ64523 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hist2h2acQ64523 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hist2h2acQ64523 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hist2h2acQ64523 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hist2h2acQ64523 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hist2h2acQ64523 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms