Protein–RNA interactions for Protein: Q64523

Hist2h2ac, Histone H2A type 2-C, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hist2h2acQ64523 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC35.16■■■■□ 3.22
Hist2h2acQ64523 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Hist2h2acQ64523 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Hist2h2acQ64523 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Hist2h2acQ64523 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Hist2h2acQ64523 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
Hist2h2acQ64523 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC31.26■■■□□ 2.59
Hist2h2acQ64523 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Hist2h2acQ64523 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
Hist2h2acQ64523 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
Hist2h2acQ64523 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Hist2h2acQ64523 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
Hist2h2acQ64523 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Hist2h2acQ64523 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Hist2h2acQ64523 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC30■■■□□ 2.39
Hist2h2acQ64523 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Hist2h2acQ64523 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Hist2h2acQ64523 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Hist2h2acQ64523 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
Hist2h2acQ64523 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Hist2h2acQ64523 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Hist2h2acQ64523 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Hist2h2acQ64523 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Hist2h2acQ64523 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Hist2h2acQ64523 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Hist2h2acQ64523 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Hist2h2acQ64523 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Hist2h2acQ64523 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Hist2h2acQ64523 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
Hist2h2acQ64523 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Hist2h2acQ64523 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Hist2h2acQ64523 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Hist2h2acQ64523 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Hist2h2acQ64523 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Hist2h2acQ64523 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Hist2h2acQ64523 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Hist2h2acQ64523 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Hist2h2acQ64523 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Hist2h2acQ64523 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Hist2h2acQ64523 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Hist2h2acQ64523 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Hist2h2acQ64523 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Hist2h2acQ64523 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Hist2h2acQ64523 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Hist2h2acQ64523 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Hist2h2acQ64523 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Hist2h2acQ64523 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Hist2h2acQ64523 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Hist2h2acQ64523 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Hist2h2acQ64523 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Hist2h2acQ64523 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Hist2h2acQ64523 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Hist2h2acQ64523 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Hist2h2acQ64523 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Hist2h2acQ64523 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Hist2h2acQ64523 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Hist2h2acQ64523 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Hist2h2acQ64523 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Hist2h2acQ64523 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Hist2h2acQ64523 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Hist2h2acQ64523 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Hist2h2acQ64523 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Hist2h2acQ64523 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Hist2h2acQ64523 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Hist2h2acQ64523 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Hist2h2acQ64523 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Hist2h2acQ64523 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Hist2h2acQ64523 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Hist2h2acQ64523 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Hist2h2acQ64523 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Hist2h2acQ64523 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Hist2h2acQ64523 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Hist2h2acQ64523 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Hist2h2acQ64523 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Hist2h2acQ64523 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Hist2h2acQ64523 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Hist2h2acQ64523 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Hist2h2acQ64523 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Hist2h2acQ64523 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Hist2h2acQ64523 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Hist2h2acQ64523 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Hist2h2acQ64523 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Hist2h2acQ64523 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Hist2h2acQ64523 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Hist2h2acQ64523 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Hist2h2acQ64523 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Hist2h2acQ64523 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Hist2h2acQ64523 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Hist2h2acQ64523 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Hist2h2acQ64523 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Hist2h2acQ64523 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Hist2h2acQ64523 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Hist2h2acQ64523 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Hist2h2acQ64523 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Hist2h2acQ64523 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Hist2h2acQ64523 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Hist2h2acQ64523 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Hist2h2acQ64523 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Hist2h2acQ64523 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Hist2h2acQ64523 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms