Protein–RNA interactions for Protein: Q62421

Sh3gl3, Endophilin-A3, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3gl3Q62421 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sh3gl3Q62421 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sh3gl3Q62421 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Sh3gl3Q62421 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sh3gl3Q62421 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Sh3gl3Q62421 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sh3gl3Q62421 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sh3gl3Q62421 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Sh3gl3Q62421 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sh3gl3Q62421 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sh3gl3Q62421 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sh3gl3Q62421 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sh3gl3Q62421 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sh3gl3Q62421 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Sh3gl3Q62421 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sh3gl3Q62421 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sh3gl3Q62421 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sh3gl3Q62421 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sh3gl3Q62421 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sh3gl3Q62421 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sh3gl3Q62421 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sh3gl3Q62421 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sh3gl3Q62421 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Sh3gl3Q62421 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Sh3gl3Q62421 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sh3gl3Q62421 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sh3gl3Q62421 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sh3gl3Q62421 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sh3gl3Q62421 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sh3gl3Q62421 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sh3gl3Q62421 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sh3gl3Q62421 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sh3gl3Q62421 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sh3gl3Q62421 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sh3gl3Q62421 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sh3gl3Q62421 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sh3gl3Q62421 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sh3gl3Q62421 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sh3gl3Q62421 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sh3gl3Q62421 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sh3gl3Q62421 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sh3gl3Q62421 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sh3gl3Q62421 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sh3gl3Q62421 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sh3gl3Q62421 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sh3gl3Q62421 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sh3gl3Q62421 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sh3gl3Q62421 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sh3gl3Q62421 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sh3gl3Q62421 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sh3gl3Q62421 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sh3gl3Q62421 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sh3gl3Q62421 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sh3gl3Q62421 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sh3gl3Q62421 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sh3gl3Q62421 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sh3gl3Q62421 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sh3gl3Q62421 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sh3gl3Q62421 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sh3gl3Q62421 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sh3gl3Q62421 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sh3gl3Q62421 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Sh3gl3Q62421 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sh3gl3Q62421 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sh3gl3Q62421 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sh3gl3Q62421 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sh3gl3Q62421 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sh3gl3Q62421 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sh3gl3Q62421 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sh3gl3Q62421 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sh3gl3Q62421 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sh3gl3Q62421 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sh3gl3Q62421 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sh3gl3Q62421 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Sh3gl3Q62421 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Sh3gl3Q62421 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sh3gl3Q62421 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sh3gl3Q62421 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sh3gl3Q62421 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sh3gl3Q62421 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sh3gl3Q62421 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sh3gl3Q62421 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sh3gl3Q62421 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sh3gl3Q62421 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sh3gl3Q62421 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sh3gl3Q62421 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sh3gl3Q62421 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sh3gl3Q62421 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sh3gl3Q62421 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sh3gl3Q62421 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sh3gl3Q62421 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sh3gl3Q62421 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sh3gl3Q62421 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sh3gl3Q62421 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sh3gl3Q62421 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sh3gl3Q62421 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sh3gl3Q62421 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sh3gl3Q62421 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sh3gl3Q62421 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sh3gl3Q62421 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.7 ms