Protein–RNA interactions for Protein: Q61500

Itm2a, Integral membrane protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itm2aQ61500 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Itm2aQ61500 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Itm2aQ61500 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Itm2aQ61500 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Itm2aQ61500 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Itm2aQ61500 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Itm2aQ61500 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Itm2aQ61500 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Itm2aQ61500 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Itm2aQ61500 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Itm2aQ61500 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Itm2aQ61500 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Itm2aQ61500 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Itm2aQ61500 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Itm2aQ61500 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Itm2aQ61500 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Itm2aQ61500 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Itm2aQ61500 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Itm2aQ61500 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Itm2aQ61500 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Itm2aQ61500 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Itm2aQ61500 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Itm2aQ61500 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Itm2aQ61500 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Itm2aQ61500 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Itm2aQ61500 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Itm2aQ61500 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Itm2aQ61500 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Itm2aQ61500 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Itm2aQ61500 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Itm2aQ61500 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Itm2aQ61500 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Itm2aQ61500 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Itm2aQ61500 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Itm2aQ61500 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Itm2aQ61500 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Itm2aQ61500 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Itm2aQ61500 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Itm2aQ61500 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Itm2aQ61500 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Itm2aQ61500 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Itm2aQ61500 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Itm2aQ61500 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Itm2aQ61500 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Itm2aQ61500 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Itm2aQ61500 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Itm2aQ61500 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Itm2aQ61500 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Itm2aQ61500 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Itm2aQ61500 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Itm2aQ61500 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Itm2aQ61500 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Itm2aQ61500 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Itm2aQ61500 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Itm2aQ61500 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Itm2aQ61500 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Itm2aQ61500 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Itm2aQ61500 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Itm2aQ61500 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Itm2aQ61500 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Itm2aQ61500 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Itm2aQ61500 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Itm2aQ61500 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Itm2aQ61500 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Itm2aQ61500 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Itm2aQ61500 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Itm2aQ61500 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Itm2aQ61500 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Itm2aQ61500 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Itm2aQ61500 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Itm2aQ61500 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Itm2aQ61500 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Itm2aQ61500 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Itm2aQ61500 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Itm2aQ61500 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Itm2aQ61500 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Itm2aQ61500 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Itm2aQ61500 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Itm2aQ61500 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Itm2aQ61500 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Itm2aQ61500 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Itm2aQ61500 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Itm2aQ61500 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Itm2aQ61500 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Itm2aQ61500 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Itm2aQ61500 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Itm2aQ61500 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Itm2aQ61500 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Itm2aQ61500 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Itm2aQ61500 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Itm2aQ61500 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Itm2aQ61500 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Itm2aQ61500 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Itm2aQ61500 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Itm2aQ61500 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Itm2aQ61500 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Itm2aQ61500 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Itm2aQ61500 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Itm2aQ61500 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Itm2aQ61500 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms