Protein–RNA interactions for Protein: Q61362

Chi3l1, Chitinase-3-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chi3l1Q61362 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Chi3l1Q61362 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Chi3l1Q61362 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Chi3l1Q61362 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Chi3l1Q61362 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Chi3l1Q61362 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Chi3l1Q61362 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Chi3l1Q61362 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Chi3l1Q61362 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Chi3l1Q61362 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Chi3l1Q61362 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Chi3l1Q61362 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Chi3l1Q61362 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Chi3l1Q61362 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Chi3l1Q61362 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Chi3l1Q61362 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Chi3l1Q61362 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Chi3l1Q61362 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Chi3l1Q61362 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Chi3l1Q61362 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Chi3l1Q61362 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Chi3l1Q61362 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Chi3l1Q61362 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Chi3l1Q61362 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Chi3l1Q61362 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Chi3l1Q61362 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Chi3l1Q61362 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Chi3l1Q61362 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Chi3l1Q61362 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Chi3l1Q61362 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Chi3l1Q61362 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Chi3l1Q61362 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Chi3l1Q61362 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Chi3l1Q61362 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Chi3l1Q61362 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Chi3l1Q61362 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Chi3l1Q61362 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Chi3l1Q61362 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Chi3l1Q61362 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Chi3l1Q61362 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Chi3l1Q61362 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Chi3l1Q61362 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Chi3l1Q61362 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Chi3l1Q61362 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Chi3l1Q61362 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Chi3l1Q61362 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Chi3l1Q61362 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Chi3l1Q61362 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Chi3l1Q61362 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Chi3l1Q61362 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Chi3l1Q61362 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Chi3l1Q61362 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Chi3l1Q61362 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Chi3l1Q61362 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Chi3l1Q61362 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Chi3l1Q61362 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Chi3l1Q61362 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Chi3l1Q61362 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Chi3l1Q61362 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Chi3l1Q61362 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Chi3l1Q61362 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Chi3l1Q61362 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Chi3l1Q61362 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Chi3l1Q61362 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Chi3l1Q61362 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Chi3l1Q61362 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Chi3l1Q61362 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Chi3l1Q61362 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Chi3l1Q61362 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Chi3l1Q61362 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Chi3l1Q61362 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Chi3l1Q61362 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Chi3l1Q61362 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Chi3l1Q61362 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Chi3l1Q61362 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Chi3l1Q61362 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Chi3l1Q61362 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Chi3l1Q61362 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Chi3l1Q61362 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Chi3l1Q61362 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Chi3l1Q61362 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Chi3l1Q61362 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Chi3l1Q61362 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Chi3l1Q61362 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Chi3l1Q61362 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Chi3l1Q61362 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Chi3l1Q61362 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Chi3l1Q61362 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Chi3l1Q61362 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Chi3l1Q61362 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Chi3l1Q61362 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Chi3l1Q61362 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Chi3l1Q61362 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Chi3l1Q61362 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Chi3l1Q61362 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Chi3l1Q61362 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Chi3l1Q61362 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Chi3l1Q61362 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Chi3l1Q61362 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Chi3l1Q61362 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms