Protein–RNA interactions for Protein: Q61179

Irf9, Interferon regulatory factor 9, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf9Q61179 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Irf9Q61179 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC30.41■■■□□ 2.46
Irf9Q61179 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Irf9Q61179 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Irf9Q61179 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC30.41■■■□□ 2.46
Irf9Q61179 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Irf9Q61179 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Irf9Q61179 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Irf9Q61179 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Irf9Q61179 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Irf9Q61179 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Irf9Q61179 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
Irf9Q61179 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Irf9Q61179 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Irf9Q61179 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Irf9Q61179 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC30.32■■■□□ 2.44
Irf9Q61179 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Irf9Q61179 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Irf9Q61179 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Irf9Q61179 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Irf9Q61179 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
Irf9Q61179 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
Irf9Q61179 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC30.26■■■□□ 2.43
Irf9Q61179 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Irf9Q61179 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Irf9Q61179 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Irf9Q61179 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Irf9Q61179 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Irf9Q61179 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Irf9Q61179 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Irf9Q61179 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Irf9Q61179 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Irf9Q61179 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Irf9Q61179 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Irf9Q61179 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Irf9Q61179 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Irf9Q61179 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Irf9Q61179 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Irf9Q61179 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Irf9Q61179 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Irf9Q61179 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Irf9Q61179 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
Irf9Q61179 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Irf9Q61179 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Irf9Q61179 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Irf9Q61179 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Irf9Q61179 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Irf9Q61179 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Irf9Q61179 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Irf9Q61179 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Irf9Q61179 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Irf9Q61179 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Irf9Q61179 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Irf9Q61179 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Irf9Q61179 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Irf9Q61179 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
Irf9Q61179 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Irf9Q61179 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Irf9Q61179 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Irf9Q61179 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Irf9Q61179 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Irf9Q61179 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Irf9Q61179 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Irf9Q61179 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Irf9Q61179 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Irf9Q61179 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Irf9Q61179 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Irf9Q61179 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
Irf9Q61179 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Irf9Q61179 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Irf9Q61179 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Irf9Q61179 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Irf9Q61179 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Irf9Q61179 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Irf9Q61179 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Irf9Q61179 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Irf9Q61179 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
Irf9Q61179 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Irf9Q61179 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Irf9Q61179 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Irf9Q61179 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Irf9Q61179 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Irf9Q61179 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Irf9Q61179 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC29.95■■■□□ 2.39
Irf9Q61179 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
Irf9Q61179 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Irf9Q61179 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Irf9Q61179 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Irf9Q61179 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Irf9Q61179 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Irf9Q61179 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Irf9Q61179 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Irf9Q61179 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Irf9Q61179 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Irf9Q61179 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Irf9Q61179 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Irf9Q61179 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
Irf9Q61179 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Irf9Q61179 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Irf9Q61179 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms