Protein–RNA interactions for Protein: Q61056

Trpc1, Short transient receptor potential channel 1, mousemouse

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc1Q61056 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trpc1Q61056 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trpc1Q61056 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trpc1Q61056 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trpc1Q61056 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trpc1Q61056 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trpc1Q61056 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Trpc1Q61056 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trpc1Q61056 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trpc1Q61056 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trpc1Q61056 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Trpc1Q61056 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Trpc1Q61056 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trpc1Q61056 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trpc1Q61056 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trpc1Q61056 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Trpc1Q61056 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trpc1Q61056 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trpc1Q61056 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trpc1Q61056 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trpc1Q61056 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trpc1Q61056 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trpc1Q61056 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trpc1Q61056 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trpc1Q61056 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Trpc1Q61056 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trpc1Q61056 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trpc1Q61056 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trpc1Q61056 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trpc1Q61056 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trpc1Q61056 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trpc1Q61056 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trpc1Q61056 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trpc1Q61056 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trpc1Q61056 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trpc1Q61056 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trpc1Q61056 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trpc1Q61056 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trpc1Q61056 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trpc1Q61056 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trpc1Q61056 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trpc1Q61056 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trpc1Q61056 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trpc1Q61056 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trpc1Q61056 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trpc1Q61056 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trpc1Q61056 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trpc1Q61056 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trpc1Q61056 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Trpc1Q61056 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trpc1Q61056 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trpc1Q61056 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trpc1Q61056 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trpc1Q61056 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trpc1Q61056 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trpc1Q61056 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trpc1Q61056 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trpc1Q61056 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trpc1Q61056 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trpc1Q61056 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trpc1Q61056 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trpc1Q61056 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trpc1Q61056 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trpc1Q61056 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trpc1Q61056 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trpc1Q61056 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trpc1Q61056 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trpc1Q61056 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Trpc1Q61056 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trpc1Q61056 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trpc1Q61056 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trpc1Q61056 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trpc1Q61056 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trpc1Q61056 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trpc1Q61056 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trpc1Q61056 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trpc1Q61056 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trpc1Q61056 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Trpc1Q61056 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trpc1Q61056 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trpc1Q61056 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trpc1Q61056 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trpc1Q61056 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trpc1Q61056 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trpc1Q61056 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trpc1Q61056 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trpc1Q61056 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trpc1Q61056 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trpc1Q61056 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trpc1Q61056 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trpc1Q61056 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trpc1Q61056 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trpc1Q61056 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trpc1Q61056 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trpc1Q61056 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trpc1Q61056 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trpc1Q61056 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trpc1Q61056 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trpc1Q61056 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trpc1Q61056 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms