Protein–RNA interactions for Protein: Q60770

Stxbp3, Syntaxin-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stxbp3Q60770 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Stxbp3Q60770 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Stxbp3Q60770 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Stxbp3Q60770 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Stxbp3Q60770 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Stxbp3Q60770 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Stxbp3Q60770 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Stxbp3Q60770 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Stxbp3Q60770 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Stxbp3Q60770 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Stxbp3Q60770 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Stxbp3Q60770 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Stxbp3Q60770 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Stxbp3Q60770 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Stxbp3Q60770 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Stxbp3Q60770 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Stxbp3Q60770 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Stxbp3Q60770 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Stxbp3Q60770 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Stxbp3Q60770 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Stxbp3Q60770 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Stxbp3Q60770 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Stxbp3Q60770 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Stxbp3Q60770 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Stxbp3Q60770 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Stxbp3Q60770 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Stxbp3Q60770 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Stxbp3Q60770 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Stxbp3Q60770 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Stxbp3Q60770 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Stxbp3Q60770 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Stxbp3Q60770 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Stxbp3Q60770 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Stxbp3Q60770 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Stxbp3Q60770 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Stxbp3Q60770 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Stxbp3Q60770 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Stxbp3Q60770 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Stxbp3Q60770 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Stxbp3Q60770 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Stxbp3Q60770 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Stxbp3Q60770 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Stxbp3Q60770 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Stxbp3Q60770 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC27.58■■■□□ 2
Stxbp3Q60770 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Stxbp3Q60770 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Stxbp3Q60770 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Stxbp3Q60770 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Stxbp3Q60770 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Stxbp3Q60770 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Stxbp3Q60770 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Stxbp3Q60770 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
Stxbp3Q60770 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Stxbp3Q60770 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Stxbp3Q60770 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Stxbp3Q60770 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Stxbp3Q60770 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Stxbp3Q60770 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Stxbp3Q60770 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Stxbp3Q60770 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Stxbp3Q60770 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Stxbp3Q60770 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Stxbp3Q60770 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Stxbp3Q60770 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Stxbp3Q60770 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Stxbp3Q60770 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Stxbp3Q60770 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Stxbp3Q60770 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Stxbp3Q60770 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Stxbp3Q60770 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Stxbp3Q60770 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Stxbp3Q60770 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Stxbp3Q60770 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Stxbp3Q60770 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Stxbp3Q60770 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Stxbp3Q60770 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Stxbp3Q60770 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Stxbp3Q60770 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Stxbp3Q60770 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Stxbp3Q60770 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Stxbp3Q60770 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Stxbp3Q60770 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Stxbp3Q60770 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Stxbp3Q60770 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Stxbp3Q60770 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Stxbp3Q60770 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Stxbp3Q60770 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Stxbp3Q60770 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Stxbp3Q60770 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Stxbp3Q60770 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Stxbp3Q60770 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Stxbp3Q60770 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Stxbp3Q60770 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Stxbp3Q60770 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Stxbp3Q60770 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Stxbp3Q60770 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Stxbp3Q60770 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Stxbp3Q60770 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Stxbp3Q60770 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Stxbp3Q60770 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.7 ms