Protein–RNA interactions for Protein: Q4FK66

Prpf38a, Pre-mRNA-splicing factor 38A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf38aQ4FK66 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Prpf38aQ4FK66 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Prpf38aQ4FK66 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Prpf38aQ4FK66 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Prpf38aQ4FK66 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Prpf38aQ4FK66 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Prpf38aQ4FK66 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Prpf38aQ4FK66 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Prpf38aQ4FK66 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Prpf38aQ4FK66 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Prpf38aQ4FK66 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Prpf38aQ4FK66 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Prpf38aQ4FK66 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Prpf38aQ4FK66 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Prpf38aQ4FK66 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Prpf38aQ4FK66 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Prpf38aQ4FK66 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Prpf38aQ4FK66 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Prpf38aQ4FK66 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Prpf38aQ4FK66 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Prpf38aQ4FK66 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Prpf38aQ4FK66 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Prpf38aQ4FK66 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Prpf38aQ4FK66 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Prpf38aQ4FK66 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Prpf38aQ4FK66 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Prpf38aQ4FK66 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Prpf38aQ4FK66 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Prpf38aQ4FK66 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Prpf38aQ4FK66 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Prpf38aQ4FK66 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Prpf38aQ4FK66 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Prpf38aQ4FK66 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Prpf38aQ4FK66 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Prpf38aQ4FK66 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Prpf38aQ4FK66 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Prpf38aQ4FK66 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Prpf38aQ4FK66 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Prpf38aQ4FK66 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Prpf38aQ4FK66 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Prpf38aQ4FK66 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Prpf38aQ4FK66 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Prpf38aQ4FK66 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Prpf38aQ4FK66 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Prpf38aQ4FK66 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Prpf38aQ4FK66 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Prpf38aQ4FK66 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Prpf38aQ4FK66 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Prpf38aQ4FK66 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Prpf38aQ4FK66 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Prpf38aQ4FK66 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Prpf38aQ4FK66 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Prpf38aQ4FK66 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Prpf38aQ4FK66 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Prpf38aQ4FK66 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Prpf38aQ4FK66 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Prpf38aQ4FK66 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Prpf38aQ4FK66 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Prpf38aQ4FK66 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Prpf38aQ4FK66 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Prpf38aQ4FK66 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Prpf38aQ4FK66 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Prpf38aQ4FK66 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Prpf38aQ4FK66 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Prpf38aQ4FK66 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Prpf38aQ4FK66 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Prpf38aQ4FK66 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Prpf38aQ4FK66 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Prpf38aQ4FK66 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Prpf38aQ4FK66 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Prpf38aQ4FK66 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Prpf38aQ4FK66 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Prpf38aQ4FK66 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Prpf38aQ4FK66 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Prpf38aQ4FK66 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Prpf38aQ4FK66 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Prpf38aQ4FK66 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Prpf38aQ4FK66 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Prpf38aQ4FK66 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Prpf38aQ4FK66 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Prpf38aQ4FK66 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Prpf38aQ4FK66 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Prpf38aQ4FK66 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Prpf38aQ4FK66 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Prpf38aQ4FK66 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Prpf38aQ4FK66 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Prpf38aQ4FK66 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Prpf38aQ4FK66 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Prpf38aQ4FK66 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Prpf38aQ4FK66 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Prpf38aQ4FK66 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Prpf38aQ4FK66 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Prpf38aQ4FK66 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Prpf38aQ4FK66 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Prpf38aQ4FK66 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Prpf38aQ4FK66 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Prpf38aQ4FK66 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Prpf38aQ4FK66 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Prpf38aQ4FK66 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Prpf38aQ4FK66 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms