Protein–RNA interactions for Protein: Q497M3

Apobec4, Putative C->U-editing enzyme APOBEC-4, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec4Q497M3 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Apobec4Q497M3 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Apobec4Q497M3 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Apobec4Q497M3 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Apobec4Q497M3 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Apobec4Q497M3 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Apobec4Q497M3 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Apobec4Q497M3 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Apobec4Q497M3 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Apobec4Q497M3 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Apobec4Q497M3 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Apobec4Q497M3 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Apobec4Q497M3 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Apobec4Q497M3 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Apobec4Q497M3 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Apobec4Q497M3 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Apobec4Q497M3 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Apobec4Q497M3 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Apobec4Q497M3 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Apobec4Q497M3 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Apobec4Q497M3 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Apobec4Q497M3 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Apobec4Q497M3 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Apobec4Q497M3 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Apobec4Q497M3 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Apobec4Q497M3 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Apobec4Q497M3 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Apobec4Q497M3 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Apobec4Q497M3 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Apobec4Q497M3 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Apobec4Q497M3 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Apobec4Q497M3 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Apobec4Q497M3 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Apobec4Q497M3 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Apobec4Q497M3 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Apobec4Q497M3 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Apobec4Q497M3 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Apobec4Q497M3 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Apobec4Q497M3 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Apobec4Q497M3 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Apobec4Q497M3 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Apobec4Q497M3 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Apobec4Q497M3 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Apobec4Q497M3 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Apobec4Q497M3 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Apobec4Q497M3 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Apobec4Q497M3 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Apobec4Q497M3 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Apobec4Q497M3 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Apobec4Q497M3 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Apobec4Q497M3 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Apobec4Q497M3 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Apobec4Q497M3 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Apobec4Q497M3 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Apobec4Q497M3 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Apobec4Q497M3 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Apobec4Q497M3 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Apobec4Q497M3 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Apobec4Q497M3 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Apobec4Q497M3 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Apobec4Q497M3 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Apobec4Q497M3 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Apobec4Q497M3 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Apobec4Q497M3 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Apobec4Q497M3 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Apobec4Q497M3 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Apobec4Q497M3 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Apobec4Q497M3 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Apobec4Q497M3 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Apobec4Q497M3 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Apobec4Q497M3 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Apobec4Q497M3 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Apobec4Q497M3 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Apobec4Q497M3 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Apobec4Q497M3 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Apobec4Q497M3 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Apobec4Q497M3 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Apobec4Q497M3 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Apobec4Q497M3 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Apobec4Q497M3 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Apobec4Q497M3 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Apobec4Q497M3 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Apobec4Q497M3 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Apobec4Q497M3 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Apobec4Q497M3 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Apobec4Q497M3 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Apobec4Q497M3 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Apobec4Q497M3 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Apobec4Q497M3 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Apobec4Q497M3 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Apobec4Q497M3 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Apobec4Q497M3 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Apobec4Q497M3 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Apobec4Q497M3 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Apobec4Q497M3 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Apobec4Q497M3 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Apobec4Q497M3 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Apobec4Q497M3 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Apobec4Q497M3 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Apobec4Q497M3 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms