Protein–RNA interactions for Protein: Q497M3

Apobec4, Putative C->U-editing enzyme APOBEC-4, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec4Q497M3 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC35.13■■■■□ 3.21
Apobec4Q497M3 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Apobec4Q497M3 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Apobec4Q497M3 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC30.69■■■□□ 2.5
Apobec4Q497M3 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
Apobec4Q497M3 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Apobec4Q497M3 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Apobec4Q497M3 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Apobec4Q497M3 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
Apobec4Q497M3 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
Apobec4Q497M3 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Apobec4Q497M3 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Apobec4Q497M3 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Apobec4Q497M3 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Apobec4Q497M3 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Apobec4Q497M3 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Apobec4Q497M3 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Apobec4Q497M3 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Apobec4Q497M3 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Apobec4Q497M3 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Apobec4Q497M3 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Apobec4Q497M3 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
Apobec4Q497M3 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Apobec4Q497M3 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Apobec4Q497M3 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Apobec4Q497M3 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Apobec4Q497M3 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Apobec4Q497M3 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Apobec4Q497M3 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Apobec4Q497M3 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Apobec4Q497M3 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Apobec4Q497M3 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Apobec4Q497M3 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Apobec4Q497M3 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Apobec4Q497M3 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Apobec4Q497M3 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Apobec4Q497M3 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Apobec4Q497M3 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Apobec4Q497M3 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Apobec4Q497M3 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Apobec4Q497M3 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Apobec4Q497M3 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Apobec4Q497M3 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Apobec4Q497M3 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Apobec4Q497M3 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Apobec4Q497M3 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Apobec4Q497M3 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Apobec4Q497M3 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Apobec4Q497M3 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Apobec4Q497M3 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Apobec4Q497M3 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Apobec4Q497M3 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Apobec4Q497M3 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Apobec4Q497M3 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Apobec4Q497M3 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Apobec4Q497M3 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Apobec4Q497M3 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Apobec4Q497M3 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Apobec4Q497M3 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Apobec4Q497M3 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Apobec4Q497M3 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Apobec4Q497M3 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Apobec4Q497M3 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Apobec4Q497M3 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Apobec4Q497M3 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Apobec4Q497M3 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Apobec4Q497M3 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Apobec4Q497M3 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Apobec4Q497M3 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Apobec4Q497M3 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Apobec4Q497M3 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Apobec4Q497M3 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Apobec4Q497M3 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Apobec4Q497M3 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Apobec4Q497M3 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Apobec4Q497M3 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Apobec4Q497M3 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Apobec4Q497M3 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Apobec4Q497M3 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Apobec4Q497M3 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Apobec4Q497M3 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Apobec4Q497M3 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Apobec4Q497M3 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Apobec4Q497M3 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Apobec4Q497M3 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Apobec4Q497M3 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Apobec4Q497M3 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Apobec4Q497M3 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Apobec4Q497M3 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Apobec4Q497M3 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Apobec4Q497M3 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Apobec4Q497M3 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Apobec4Q497M3 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Apobec4Q497M3 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Apobec4Q497M3 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Apobec4Q497M3 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Apobec4Q497M3 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Apobec4Q497M3 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Apobec4Q497M3 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Apobec4Q497M3 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms