Protein–RNA interactions for Protein: Q3V118

Ccdc185, Coiled-coil domain-containing 185, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc185Q3V118 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc185Q3V118 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc185Q3V118 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc185Q3V118 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc185Q3V118 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccdc185Q3V118 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ccdc185Q3V118 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc185Q3V118 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc185Q3V118 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc185Q3V118 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc185Q3V118 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc185Q3V118 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc185Q3V118 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc185Q3V118 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc185Q3V118 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc185Q3V118 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc185Q3V118 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc185Q3V118 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc185Q3V118 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc185Q3V118 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc185Q3V118 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc185Q3V118 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc185Q3V118 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ccdc185Q3V118 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc185Q3V118 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc185Q3V118 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc185Q3V118 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc185Q3V118 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc185Q3V118 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc185Q3V118 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc185Q3V118 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc185Q3V118 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc185Q3V118 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc185Q3V118 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc185Q3V118 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc185Q3V118 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc185Q3V118 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc185Q3V118 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc185Q3V118 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc185Q3V118 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc185Q3V118 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc185Q3V118 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc185Q3V118 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc185Q3V118 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc185Q3V118 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc185Q3V118 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc185Q3V118 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc185Q3V118 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc185Q3V118 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ccdc185Q3V118 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc185Q3V118 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc185Q3V118 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc185Q3V118 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc185Q3V118 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc185Q3V118 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc185Q3V118 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc185Q3V118 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc185Q3V118 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc185Q3V118 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc185Q3V118 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc185Q3V118 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc185Q3V118 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc185Q3V118 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc185Q3V118 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc185Q3V118 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc185Q3V118 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc185Q3V118 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc185Q3V118 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc185Q3V118 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc185Q3V118 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc185Q3V118 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc185Q3V118 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc185Q3V118 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc185Q3V118 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc185Q3V118 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc185Q3V118 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc185Q3V118 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc185Q3V118 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc185Q3V118 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc185Q3V118 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc185Q3V118 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc185Q3V118 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc185Q3V118 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc185Q3V118 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc185Q3V118 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc185Q3V118 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc185Q3V118 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc185Q3V118 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc185Q3V118 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc185Q3V118 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc185Q3V118 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc185Q3V118 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc185Q3V118 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc185Q3V118 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc185Q3V118 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc185Q3V118 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc185Q3V118 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc185Q3V118 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc185Q3V118 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc185Q3V118 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 135.2 ms