Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU56

Gm29609, Predicted gene 29609, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29609Q3UU56 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gm29609Q3UU56 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gm29609Q3UU56 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gm29609Q3UU56 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gm29609Q3UU56 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gm29609Q3UU56 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gm29609Q3UU56 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gm29609Q3UU56 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gm29609Q3UU56 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gm29609Q3UU56 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gm29609Q3UU56 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gm29609Q3UU56 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gm29609Q3UU56 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gm29609Q3UU56 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Gm29609Q3UU56 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gm29609Q3UU56 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gm29609Q3UU56 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Gm29609Q3UU56 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Gm29609Q3UU56 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gm29609Q3UU56 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gm29609Q3UU56 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gm29609Q3UU56 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gm29609Q3UU56 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gm29609Q3UU56 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gm29609Q3UU56 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gm29609Q3UU56 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gm29609Q3UU56 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gm29609Q3UU56 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gm29609Q3UU56 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gm29609Q3UU56 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gm29609Q3UU56 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gm29609Q3UU56 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gm29609Q3UU56 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gm29609Q3UU56 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gm29609Q3UU56 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gm29609Q3UU56 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gm29609Q3UU56 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gm29609Q3UU56 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gm29609Q3UU56 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gm29609Q3UU56 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gm29609Q3UU56 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gm29609Q3UU56 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gm29609Q3UU56 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Gm29609Q3UU56 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gm29609Q3UU56 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gm29609Q3UU56 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gm29609Q3UU56 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gm29609Q3UU56 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gm29609Q3UU56 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gm29609Q3UU56 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gm29609Q3UU56 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gm29609Q3UU56 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gm29609Q3UU56 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gm29609Q3UU56 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gm29609Q3UU56 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gm29609Q3UU56 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Gm29609Q3UU56 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Gm29609Q3UU56 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gm29609Q3UU56 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gm29609Q3UU56 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gm29609Q3UU56 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gm29609Q3UU56 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gm29609Q3UU56 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gm29609Q3UU56 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gm29609Q3UU56 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gm29609Q3UU56 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gm29609Q3UU56 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gm29609Q3UU56 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gm29609Q3UU56 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gm29609Q3UU56 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gm29609Q3UU56 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gm29609Q3UU56 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gm29609Q3UU56 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gm29609Q3UU56 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gm29609Q3UU56 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gm29609Q3UU56 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gm29609Q3UU56 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gm29609Q3UU56 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gm29609Q3UU56 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gm29609Q3UU56 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gm29609Q3UU56 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gm29609Q3UU56 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gm29609Q3UU56 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Gm29609Q3UU56 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gm29609Q3UU56 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gm29609Q3UU56 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gm29609Q3UU56 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gm29609Q3UU56 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gm29609Q3UU56 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gm29609Q3UU56 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gm29609Q3UU56 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gm29609Q3UU56 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gm29609Q3UU56 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gm29609Q3UU56 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gm29609Q3UU56 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gm29609Q3UU56 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gm29609Q3UU56 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gm29609Q3UU56 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gm29609Q3UU56 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gm29609Q3UU56 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.7 ms