Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHI4

Tmed8, Protein TMED8, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed8Q3UHI4 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Tmed8Q3UHI4 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Tmed8Q3UHI4 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Tmed8Q3UHI4 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Tmed8Q3UHI4 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Tmed8Q3UHI4 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Tmed8Q3UHI4 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Tmed8Q3UHI4 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Tmed8Q3UHI4 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Tmed8Q3UHI4 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Tmed8Q3UHI4 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Tmed8Q3UHI4 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Tmed8Q3UHI4 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Tmed8Q3UHI4 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Tmed8Q3UHI4 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Tmed8Q3UHI4 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Tmed8Q3UHI4 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Tmed8Q3UHI4 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Tmed8Q3UHI4 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Tmed8Q3UHI4 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Tmed8Q3UHI4 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Tmed8Q3UHI4 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Tmed8Q3UHI4 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Tmed8Q3UHI4 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Tmed8Q3UHI4 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Tmed8Q3UHI4 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Tmed8Q3UHI4 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Tmed8Q3UHI4 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Tmed8Q3UHI4 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Tmed8Q3UHI4 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Tmed8Q3UHI4 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Tmed8Q3UHI4 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Tmed8Q3UHI4 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Tmed8Q3UHI4 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Tmed8Q3UHI4 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Tmed8Q3UHI4 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Tmed8Q3UHI4 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Tmed8Q3UHI4 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Tmed8Q3UHI4 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Tmed8Q3UHI4 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Tmed8Q3UHI4 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Tmed8Q3UHI4 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Tmed8Q3UHI4 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Tmed8Q3UHI4 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Tmed8Q3UHI4 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Tmed8Q3UHI4 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Tmed8Q3UHI4 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Tmed8Q3UHI4 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Tmed8Q3UHI4 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Tmed8Q3UHI4 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Tmed8Q3UHI4 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Tmed8Q3UHI4 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Tmed8Q3UHI4 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Tmed8Q3UHI4 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Tmed8Q3UHI4 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Tmed8Q3UHI4 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Tmed8Q3UHI4 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Tmed8Q3UHI4 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Tmed8Q3UHI4 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Tmed8Q3UHI4 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Tmed8Q3UHI4 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Tmed8Q3UHI4 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Tmed8Q3UHI4 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Tmed8Q3UHI4 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Tmed8Q3UHI4 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Tmed8Q3UHI4 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Tmed8Q3UHI4 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Tmed8Q3UHI4 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Tmed8Q3UHI4 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Tmed8Q3UHI4 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Tmed8Q3UHI4 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Tmed8Q3UHI4 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Tmed8Q3UHI4 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Tmed8Q3UHI4 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Tmed8Q3UHI4 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Tmed8Q3UHI4 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Tmed8Q3UHI4 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Tmed8Q3UHI4 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Tmed8Q3UHI4 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Tmed8Q3UHI4 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Tmed8Q3UHI4 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Tmed8Q3UHI4 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Tmed8Q3UHI4 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Tmed8Q3UHI4 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Tmed8Q3UHI4 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Tmed8Q3UHI4 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Tmed8Q3UHI4 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Tmed8Q3UHI4 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Tmed8Q3UHI4 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Tmed8Q3UHI4 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Tmed8Q3UHI4 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Tmed8Q3UHI4 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Tmed8Q3UHI4 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Tmed8Q3UHI4 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Tmed8Q3UHI4 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Tmed8Q3UHI4 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Tmed8Q3UHI4 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Tmed8Q3UHI4 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Tmed8Q3UHI4 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Tmed8Q3UHI4 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 117.7 ms