Protein–RNA interactions for Protein: Q3TEI4

Uncharacterized protein C15orf39 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,023 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TEI4 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Q3TEI4 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Q3TEI4 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Q3TEI4 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Q3TEI4 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Q3TEI4 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q3TEI4 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q3TEI4 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q3TEI4 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Q3TEI4 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Q3TEI4 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Q3TEI4 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Q3TEI4 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q3TEI4 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q3TEI4 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q3TEI4 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Q3TEI4 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q3TEI4 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q3TEI4 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q3TEI4 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q3TEI4 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q3TEI4 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q3TEI4 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q3TEI4 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q3TEI4 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q3TEI4 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q3TEI4 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q3TEI4 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q3TEI4 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q3TEI4 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q3TEI4 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q3TEI4 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q3TEI4 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q3TEI4 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q3TEI4 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q3TEI4 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q3TEI4 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q3TEI4 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Q3TEI4 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Q3TEI4 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Q3TEI4 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Q3TEI4 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Q3TEI4 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Q3TEI4 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Q3TEI4 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Q3TEI4 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Q3TEI4 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Q3TEI4 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Q3TEI4 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Q3TEI4 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Q3TEI4 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Q3TEI4 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Q3TEI4 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Q3TEI4 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Q3TEI4 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Q3TEI4 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Q3TEI4 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q3TEI4 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q3TEI4 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q3TEI4 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q3TEI4 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q3TEI4 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q3TEI4 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q3TEI4 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q3TEI4 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q3TEI4 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q3TEI4 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q3TEI4 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q3TEI4 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q3TEI4 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q3TEI4 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q3TEI4 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q3TEI4 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q3TEI4 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Q3TEI4 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Q3TEI4 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Q3TEI4 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q3TEI4 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q3TEI4 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q3TEI4 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q3TEI4 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q3TEI4 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q3TEI4 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q3TEI4 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q3TEI4 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q3TEI4 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q3TEI4 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q3TEI4 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q3TEI4 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q3TEI4 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q3TEI4 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q3TEI4 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Q3TEI4 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Q3TEI4 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Q3TEI4 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Q3TEI4 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Q3TEI4 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Q3TEI4 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Q3TEI4 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Q3TEI4 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms