Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNP5

V1rd19, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
V1rd19Q3KNP5 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
V1rd19Q3KNP5 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
V1rd19Q3KNP5 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
V1rd19Q3KNP5 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
V1rd19Q3KNP5 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
V1rd19Q3KNP5 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
V1rd19Q3KNP5 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
V1rd19Q3KNP5 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
V1rd19Q3KNP5 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
V1rd19Q3KNP5 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
V1rd19Q3KNP5 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
V1rd19Q3KNP5 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
V1rd19Q3KNP5 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
V1rd19Q3KNP5 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
V1rd19Q3KNP5 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
V1rd19Q3KNP5 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
V1rd19Q3KNP5 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
V1rd19Q3KNP5 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
V1rd19Q3KNP5 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
V1rd19Q3KNP5 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
V1rd19Q3KNP5 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
V1rd19Q3KNP5 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
V1rd19Q3KNP5 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
V1rd19Q3KNP5 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
V1rd19Q3KNP5 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
V1rd19Q3KNP5 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
V1rd19Q3KNP5 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
V1rd19Q3KNP5 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
V1rd19Q3KNP5 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
V1rd19Q3KNP5 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
V1rd19Q3KNP5 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
V1rd19Q3KNP5 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
V1rd19Q3KNP5 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
V1rd19Q3KNP5 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
V1rd19Q3KNP5 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
V1rd19Q3KNP5 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
V1rd19Q3KNP5 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
V1rd19Q3KNP5 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
V1rd19Q3KNP5 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
V1rd19Q3KNP5 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
V1rd19Q3KNP5 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
V1rd19Q3KNP5 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
V1rd19Q3KNP5 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
V1rd19Q3KNP5 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
V1rd19Q3KNP5 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
V1rd19Q3KNP5 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
V1rd19Q3KNP5 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
V1rd19Q3KNP5 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
V1rd19Q3KNP5 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
V1rd19Q3KNP5 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
V1rd19Q3KNP5 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
V1rd19Q3KNP5 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
V1rd19Q3KNP5 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
V1rd19Q3KNP5 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
V1rd19Q3KNP5 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
V1rd19Q3KNP5 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
V1rd19Q3KNP5 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
V1rd19Q3KNP5 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
V1rd19Q3KNP5 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
V1rd19Q3KNP5 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
V1rd19Q3KNP5 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
V1rd19Q3KNP5 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
V1rd19Q3KNP5 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
V1rd19Q3KNP5 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
V1rd19Q3KNP5 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
V1rd19Q3KNP5 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
V1rd19Q3KNP5 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
V1rd19Q3KNP5 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
V1rd19Q3KNP5 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
V1rd19Q3KNP5 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
V1rd19Q3KNP5 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
V1rd19Q3KNP5 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
V1rd19Q3KNP5 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
V1rd19Q3KNP5 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
V1rd19Q3KNP5 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
V1rd19Q3KNP5 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
V1rd19Q3KNP5 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
V1rd19Q3KNP5 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
V1rd19Q3KNP5 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
V1rd19Q3KNP5 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
V1rd19Q3KNP5 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
V1rd19Q3KNP5 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
V1rd19Q3KNP5 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
V1rd19Q3KNP5 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
V1rd19Q3KNP5 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
V1rd19Q3KNP5 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
V1rd19Q3KNP5 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
V1rd19Q3KNP5 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
V1rd19Q3KNP5 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
V1rd19Q3KNP5 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
V1rd19Q3KNP5 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
V1rd19Q3KNP5 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
V1rd19Q3KNP5 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
V1rd19Q3KNP5 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
V1rd19Q3KNP5 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
V1rd19Q3KNP5 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
V1rd19Q3KNP5 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
V1rd19Q3KNP5 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
V1rd19Q3KNP5 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
V1rd19Q3KNP5 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms