Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ptchd1Q14B62 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ptchd1Q14B62 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ptchd1Q14B62 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ptchd1Q14B62 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ptchd1Q14B62 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ptchd1Q14B62 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ptchd1Q14B62 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ptchd1Q14B62 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ptchd1Q14B62 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ptchd1Q14B62 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ptchd1Q14B62 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ptchd1Q14B62 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ptchd1Q14B62 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ptchd1Q14B62 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ptchd1Q14B62 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ptchd1Q14B62 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ptchd1Q14B62 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ptchd1Q14B62 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ptchd1Q14B62 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ptchd1Q14B62 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ptchd1Q14B62 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ptchd1Q14B62 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ptchd1Q14B62 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ptchd1Q14B62 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ptchd1Q14B62 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ptchd1Q14B62 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ptchd1Q14B62 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ptchd1Q14B62 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ptchd1Q14B62 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ptchd1Q14B62 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ptchd1Q14B62 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ptchd1Q14B62 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ptchd1Q14B62 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ptchd1Q14B62 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ptchd1Q14B62 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ptchd1Q14B62 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ptchd1Q14B62 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ptchd1Q14B62 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ptchd1Q14B62 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ptchd1Q14B62 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ptchd1Q14B62 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ptchd1Q14B62 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ptchd1Q14B62 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ptchd1Q14B62 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ptchd1Q14B62 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ptchd1Q14B62 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ptchd1Q14B62 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ptchd1Q14B62 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ptchd1Q14B62 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ptchd1Q14B62 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ptchd1Q14B62 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ptchd1Q14B62 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ptchd1Q14B62 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ptchd1Q14B62 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ptchd1Q14B62 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ptchd1Q14B62 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ptchd1Q14B62 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ptchd1Q14B62 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ptchd1Q14B62 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ptchd1Q14B62 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ptchd1Q14B62 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ptchd1Q14B62 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ptchd1Q14B62 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ptchd1Q14B62 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ptchd1Q14B62 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ptchd1Q14B62 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ptchd1Q14B62 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ptchd1Q14B62 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ptchd1Q14B62 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ptchd1Q14B62 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ptchd1Q14B62 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ptchd1Q14B62 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ptchd1Q14B62 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ptchd1Q14B62 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ptchd1Q14B62 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ptchd1Q14B62 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ptchd1Q14B62 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ptchd1Q14B62 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ptchd1Q14B62 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ptchd1Q14B62 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ptchd1Q14B62 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ptchd1Q14B62 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ptchd1Q14B62 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ptchd1Q14B62 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ptchd1Q14B62 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ptchd1Q14B62 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ptchd1Q14B62 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ptchd1Q14B62 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ptchd1Q14B62 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ptchd1Q14B62 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ptchd1Q14B62 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ptchd1Q14B62 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ptchd1Q14B62 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ptchd1Q14B62 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ptchd1Q14B62 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ptchd1Q14B62 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ptchd1Q14B62 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ptchd1Q14B62 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ptchd1Q14B62 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
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