Protein–RNA interactions for Protein: Q08490

SGO1, Shugoshin, yeastyeast

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Length 590 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SGO1Q08490 EMC3YKL207W 762 nt8.76□□□□□ -1.01
SGO1Q08490 BSP1YPR171W 1731 nt8.76□□□□□ -1.01
SGO1Q08490 KAE1YKR038C 1161 nt8.75□□□□□ -1.01
SGO1Q08490 ERG13YML126C 1476 nt8.73□□□□□ -1.01
SGO1Q08490 MRP1YDR347W 966 nt8.73□□□□□ -1.01
SGO1Q08490 SRP102YKL154W 735 nt8.73□□□□□ -1.01
SGO1Q08490 ODC1YPL134C 933 nt8.73□□□□□ -1.01
SGO1Q08490 DIG1YPL049C 1359 nt8.73□□□□□ -1.01
SGO1Q08490 TPC1YGR096W 945 nt8.72□□□□□ -1.01
SGO1Q08490 OPI3YJR073C 621 nt8.72□□□□□ -1.01
SGO1Q08490 ERO1YML130C 1692 nt8.72□□□□□ -1.01
SGO1Q08490 YKR012CYKR012C 378 nt8.71□□□□□ -1.02
SGO1Q08490 SPP2YOR148C 558 nt8.71□□□□□ -1.02
SGO1Q08490 YJL160CYJL160C 864 nt8.7□□□□□ -1.02
SGO1Q08490 ASP3-1YLR155C 1089 nt8.69□□□□□ -1.02
SGO1Q08490 ASP3-2YLR157C 1089 nt8.69□□□□□ -1.02
SGO1Q08490 ASP3-3YLR158C 1089 nt8.69□□□□□ -1.02
SGO1Q08490 ASP3-4YLR160C 1089 nt8.69□□□□□ -1.02
SGO1Q08490 ENO2YHR174W 1314 nt8.69□□□□□ -1.02
SGO1Q08490 tL(UAA)B1tL(UAA)B1 84 nt8.68□□□□□ -1.02
SGO1Q08490 tL(UAA)B2tL(UAA)B2 84 nt8.68□□□□□ -1.02
SGO1Q08490 tL(UAA)DtL(UAA)D 84 nt8.68□□□□□ -1.02
SGO1Q08490 SUP51tL(UAA)J 84 nt8.68□□□□□ -1.02
SGO1Q08490 tL(UAA)KtL(UAA)K 84 nt8.68□□□□□ -1.02
SGO1Q08490 tL(UAA)LtL(UAA)L 84 nt8.68□□□□□ -1.02
SGO1Q08490 tL(UAA)NtL(UAA)N 84 nt8.68□□□□□ -1.02
SGO1Q08490 YLR280CYLR280C 351 nt8.67□□□□□ -1.02
SGO1Q08490 SDS24YBR214W 1584 nt8.67□□□□□ -1.02
SGO1Q08490 YPL247CYPL247C 1572 nt8.66□□□□□ -1.02
SGO1Q08490 AMF1YOR378W 1548 nt8.66□□□□□ -1.02
SGO1Q08490 YMR210WYMR210W 1350 nt8.66□□□□□ -1.02
SGO1Q08490 YPL108WYPL108W 507 nt8.66□□□□□ -1.02
SGO1Q08490 YOR072WYOR072W 315 nt8.65□□□□□ -1.02
SGO1Q08490 ENO1YGR254W 1314 nt8.64□□□□□ -1.03
SGO1Q08490 SSL2YIL143C 2532 nt8.64□□□□□ -1.03
SGO1Q08490 ACH1YBL015W 1581 nt8.64□□□□□ -1.03
SGO1Q08490 BAP3YDR046C 1815 nt8.64□□□□□ -1.03
SGO1Q08490 GID8YMR135C 1368 nt8.62□□□□□ -1.03
SGO1Q08490 TOK1YJL093C 2076 nt8.62□□□□□ -1.03
SGO1Q08490 PRE5YMR314W 705 nt8.62□□□□□ -1.03
SGO1Q08490 SDH8YBR269C 417 nt8.62□□□□□ -1.03
SGO1Q08490 LEU2YCL018W 1095 nt8.62□□□□□ -1.03
SGO1Q08490 HXT10YFL011W 1641 nt8.62□□□□□ -1.03
SGO1Q08490 MRS6YOR370C 1812 nt8.61□□□□□ -1.03
SGO1Q08490 VBA3YCL069W 1377 nt8.6□□□□□ -1.03
SGO1Q08490 GDH1YOR375C 1365 nt8.6□□□□□ -1.03
SGO1Q08490 NAM8YHR086W 1572 nt8.59□□□□□ -1.03
SGO1Q08490 SAC7YDR389W 1965 nt8.59□□□□□ -1.03
SGO1Q08490 MEX67YPL169C 1800 nt8.58□□□□□ -1.04
SGO1Q08490 RFC1YOR217W 2586 nt8.58□□□□□ -1.04
SGO1Q08490 YKL133CYKL133C 1392 nt8.57□□□□□ -1.04
SGO1Q08490 MDL2YPL270W 2322 nt8.57□□□□□ -1.04
SGO1Q08490 MDM35YKL053C-A 261 nt8.56□□□□□ -1.04
SGO1Q08490 RIM2YBR192W 1134 nt8.56□□□□□ -1.04
SGO1Q08490 ADA2YDR448W 1305 nt8.55□□□□□ -1.04
SGO1Q08490 MTO1YGL236C 2010 nt8.55□□□□□ -1.04
SGO1Q08490 VPS62YGR141W 1404 nt8.54□□□□□ -1.04
SGO1Q08490 PET18YCR020C 648 nt8.53□□□□□ -1.04
SGO1Q08490 YDR510C-AYDR510C-A 117 nt8.53□□□□□ -1.04
SGO1Q08490 YNR064CYNR064C 873 nt8.52□□□□□ -1.05
SGO1Q08490 UTR5YEL035C 501 nt8.51□□□□□ -1.05
SGO1Q08490 REX2YLR059C 810 nt8.51□□□□□ -1.05
SGO1Q08490 YHR219WYHR219W 1875 nt8.49□□□□□ -1.05
SGO1Q08490 TAD2YJL035C 753 nt8.49□□□□□ -1.05
SGO1Q08490 AIM1YAL046C 357 nt8.49□□□□□ -1.05
SGO1Q08490 NBA1YOL070C 1506 nt8.49□□□□□ -1.05
SGO1Q08490 ELP4YPL101W 1371 nt8.48□□□□□ -1.05
SGO1Q08490 HEM14YER014W 1620 nt8.48□□□□□ -1.05
SGO1Q08490 YRF1-2YER190W 5046 nt8.48□□□□□ -1.05
SGO1Q08490 YDL086WYDL086W 822 nt8.47□□□□□ -1.05
SGO1Q08490 SWT21YNL187W 1074 nt8.47□□□□□ -1.05
SGO1Q08490 LSP1YPL004C 1026 nt8.47□□□□□ -1.05
SGO1Q08490 AGP3YFL055W 1677 nt8.46□□□□□ -1.06
SGO1Q08490 YJR149WYJR149W 1215 nt8.45□□□□□ -1.06
SGO1Q08490 PAB1YER165W 1734 nt8.45□□□□□ -1.06
SGO1Q08490 YFR020WYFR020W 699 nt8.44□□□□□ -1.06
SGO1Q08490 ADE1YAR015W 921 nt8.44□□□□□ -1.06
SGO1Q08490 MFT1YML062C 1179 nt8.44□□□□□ -1.06
SGO1Q08490 FUS3YBL016W 1062 nt8.43□□□□□ -1.06
SGO1Q08490 YMR166CYMR166C 1107 nt8.43□□□□□ -1.06
SGO1Q08490 SFL1YOR140W 2301 nt8.42□□□□□ -1.06
SGO1Q08490 ELO1YJL196C 933 nt8.42□□□□□ -1.06
SGO1Q08490 CWP2YKL096W-A 279 nt8.42□□□□□ -1.06
SGO1Q08490 PET494YNR045W 1470 nt8.42□□□□□ -1.06
SGO1Q08490 TPN1YGL186C 1740 nt8.4□□□□□ -1.06
SGO1Q08490 YJL043WYJL043W 774 nt8.4□□□□□ -1.06
SGO1Q08490 ENT4YLL038C 744 nt8.4□□□□□ -1.06
SGO1Q08490 KEL3YPL263C 1956 nt8.39□□□□□ -1.07
SGO1Q08490 YER156CYER156C 1017 nt8.39□□□□□ -1.07
SGO1Q08490 SRP54YPR088C 1626 nt8.39□□□□□ -1.07
SGO1Q08490 MET1YKR069W 1782 nt8.38□□□□□ -1.07
SGO1Q08490 tD(GUC)BtD(GUC)B 72 nt8.37□□□□□ -1.07
SGO1Q08490 tD(GUC)DtD(GUC)D 72 nt8.37□□□□□ -1.07
SGO1Q08490 tD(GUC)G1tD(GUC)G1 72 nt8.37□□□□□ -1.07
SGO1Q08490 tD(GUC)G2tD(GUC)G2 72 nt8.37□□□□□ -1.07
SGO1Q08490 tD(GUC)I1tD(GUC)I1 72 nt8.37□□□□□ -1.07
SGO1Q08490 tD(GUC)I2tD(GUC)I2 72 nt8.37□□□□□ -1.07
SGO1Q08490 tD(GUC)J1tD(GUC)J1 72 nt8.37□□□□□ -1.07
SGO1Q08490 tD(GUC)J2tD(GUC)J2 72 nt8.37□□□□□ -1.07
SGO1Q08490 tD(GUC)J3tD(GUC)J3 72 nt8.37□□□□□ -1.07
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