Protein–RNA interactions for Protein: Q08438

VHS3, Phosphopantothenoylcysteine decarboxylase subunit VHS3, yeastyeast

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Length 674 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VHS3Q08438 tD(GUC)J4tD(GUC)J4 72 nt8.59□□□□□ -1.03
VHS3Q08438 tD(GUC)KtD(GUC)K 72 nt8.59□□□□□ -1.03
VHS3Q08438 tD(GUC)L1tD(GUC)L1 72 nt8.59□□□□□ -1.03
VHS3Q08438 tD(GUC)L2tD(GUC)L2 72 nt8.59□□□□□ -1.03
VHS3Q08438 tD(GUC)MtD(GUC)M 72 nt8.59□□□□□ -1.03
VHS3Q08438 tD(GUC)OtD(GUC)O 72 nt8.59□□□□□ -1.03
VHS3Q08438 SBP1YHL034C 885 nt8.59□□□□□ -1.03
VHS3Q08438 YKL053WYKL053W 375 nt8.59□□□□□ -1.03
VHS3Q08438 YMC2YBR104W 990 nt8.59□□□□□ -1.03
VHS3Q08438 YEL008WYEL008W 381 nt8.58□□□□□ -1.04
VHS3Q08438 FUN14YAL008W 597 nt8.58□□□□□ -1.04
VHS3Q08438 MIM1YOL026C 342 nt8.58□□□□□ -1.04
VHS3Q08438 LEU2YCL018W 1095 nt8.58□□□□□ -1.04
VHS3Q08438 POT1YIL160C 1254 nt8.57□□□□□ -1.04
VHS3Q08438 MTO1YGL236C 2010 nt8.57□□□□□ -1.04
VHS3Q08438 THI3YDL080C 1830 nt8.57□□□□□ -1.04
VHS3Q08438 SAN1YDR143C 1833 nt8.57□□□□□ -1.04
VHS3Q08438 YMR316C-BYMR316C-B 309 nt8.56□□□□□ -1.04
VHS3Q08438 AAT1YKL106W 1356 nt8.54□□□□□ -1.04
VHS3Q08438 HBS1YKR084C 1836 nt8.54□□□□□ -1.04
VHS3Q08438 MEX67YPL169C 1800 nt8.53□□□□□ -1.04
VHS3Q08438 TPC1YGR096W 945 nt8.53□□□□□ -1.04
VHS3Q08438 EMC3YKL207W 762 nt8.53□□□□□ -1.04
VHS3Q08438 PAB1YER165W 1734 nt8.53□□□□□ -1.04
VHS3Q08438 THI6YPL214C 1623 nt8.53□□□□□ -1.04
VHS3Q08438 GNP1YDR508C 1992 nt8.53□□□□□ -1.04
VHS3Q08438 TRP2YER090W 1524 nt8.53□□□□□ -1.04
VHS3Q08438 SRP54YPR088C 1626 nt8.51□□□□□ -1.05
VHS3Q08438 MRS4YKR052C 915 nt8.51□□□□□ -1.05
VHS3Q08438 HXT11YOL156W 1704 nt8.51□□□□□ -1.05
VHS3Q08438 NAM8YHR086W 1572 nt8.49□□□□□ -1.05
VHS3Q08438 ORT1YOR130C 879 nt8.49□□□□□ -1.05
VHS3Q08438 GAS1YMR307W 1680 nt8.47□□□□□ -1.05
VHS3Q08438 AAC3YBR085W 924 nt8.47□□□□□ -1.05
VHS3Q08438 TPN1YGL186C 1740 nt8.46□□□□□ -1.05
VHS3Q08438 GSF2YML048W 1212 nt8.46□□□□□ -1.06
VHS3Q08438 YPT11YNL304W 1254 nt8.46□□□□□ -1.06
VHS3Q08438 MDL2YPL270W 2322 nt8.45□□□□□ -1.06
VHS3Q08438 REX2YLR059C 810 nt8.45□□□□□ -1.06
VHS3Q08438 PTC6YCR079W 1329 nt8.44□□□□□ -1.06
VHS3Q08438 YMR210WYMR210W 1350 nt8.44□□□□□ -1.06
VHS3Q08438 DUR3YHL016C 2208 nt8.44□□□□□ -1.06
VHS3Q08438 ESS1YJR017C 513 nt8.43□□□□□ -1.06
VHS3Q08438 TUB4YLR212C 1422 nt8.43□□□□□ -1.06
VHS3Q08438 NIF3YGL221C 867 nt8.42□□□□□ -1.06
VHS3Q08438 TMS1YDR105C 1422 nt8.42□□□□□ -1.06
VHS3Q08438 TOM71YHR117W 1920 nt8.41□□□□□ -1.06
VHS3Q08438 FSH2YMR222C 672 nt8.41□□□□□ -1.06
VHS3Q08438 YLR072WYLR072W 2082 nt8.41□□□□□ -1.06
VHS3Q08438 SRM1YGL097W 1449 nt8.4□□□□□ -1.06
VHS3Q08438 snR86snR86 1004 nt8.39□□□□□ -1.07
VHS3Q08438 KRE1YNL322C 942 nt8.39□□□□□ -1.07
VHS3Q08438 FRA1YLL029W 2250 nt8.38□□□□□ -1.07
VHS3Q08438 SPE2YOL052C 1191 nt8.38□□□□□ -1.07
VHS3Q08438 LEA1YPL213W 717 nt8.38□□□□□ -1.07
VHS3Q08438 THP3YPR045C 1413 nt8.37□□□□□ -1.07
VHS3Q08438 CPD1YGR247W 720 nt8.35□□□□□ -1.07
VHS3Q08438 YJL009WYJL009W 327 nt8.35□□□□□ -1.07
VHS3Q08438 APS2YJR058C 444 nt8.35□□□□□ -1.07
VHS3Q08438 NSG2YNL156C 900 nt8.35□□□□□ -1.07
VHS3Q08438 STE4YOR212W 1272 nt8.35□□□□□ -1.07
VHS3Q08438 PAU21YOR394W 495 nt8.35□□□□□ -1.07
VHS3Q08438 PAU22YPL282C 495 nt8.35□□□□□ -1.07
VHS3Q08438 snR4snR4 186 nt8.35□□□□□ -1.07
VHS3Q08438 YIR035CYIR035C 765 nt8.34□□□□□ -1.07
VHS3Q08438 PAR32YDL173W 888 nt8.33□□□□□ -1.08
VHS3Q08438 LYS20YDL182W 1287 nt8.33□□□□□ -1.08
VHS3Q08438 UFD1YGR048W 1086 nt8.32□□□□□ -1.08
VHS3Q08438 RSM7YJR113C 744 nt8.32□□□□□ -1.08
VHS3Q08438 YKR012CYKR012C 378 nt8.32□□□□□ -1.08
VHS3Q08438 HIS3YOR202W 663 nt8.32□□□□□ -1.08
VHS3Q08438 FTH1YBR207W 1398 nt8.32□□□□□ -1.08
VHS3Q08438 DIA4YHR011W 1341 nt8.31□□□□□ -1.08
VHS3Q08438 ADE16YLR028C 1776 nt8.31□□□□□ -1.08
VHS3Q08438 NAS6YGR232W 687 nt8.3□□□□□ -1.08
VHS3Q08438 NAS2YIL007C 663 nt8.3□□□□□ -1.08
VHS3Q08438 YRF1-1YDR545W 5391 nt8.3□□□□□ -1.08
VHS3Q08438 YRF1-5YLR467W 5391 nt8.3□□□□□ -1.08
VHS3Q08438 YRF1-8YOR396W 5391 nt8.3□□□□□ -1.08
VHS3Q08438 SDS24YBR214W 1584 nt8.3□□□□□ -1.08
VHS3Q08438 BUB2YMR055C 921 nt8.29□□□□□ -1.08
VHS3Q08438 YBR056WYBR056W 1506 nt8.29□□□□□ -1.08
VHS3Q08438 FIT1YDR534C 1587 nt8.28□□□□□ -1.08
VHS3Q08438 VBA3YCL069W 1377 nt8.28□□□□□ -1.08
VHS3Q08438 YJR149WYJR149W 1215 nt8.28□□□□□ -1.08
VHS3Q08438 YEL009C-AYEL009C-A 408 nt8.27□□□□□ -1.09
VHS3Q08438 YLR349WYLR349W 507 nt8.27□□□□□ -1.09
VHS3Q08438 ARO7YPR060C 771 nt8.27□□□□□ -1.09
VHS3Q08438 ABP1YCR088W 1779 nt8.27□□□□□ -1.09
VHS3Q08438 POP2YNR052C 1302 nt8.27□□□□□ -1.09
VHS3Q08438 LPD1YFL018C 1500 nt8.25□□□□□ -1.09
VHS3Q08438 DUS3YLR401C 2007 nt8.25□□□□□ -1.09
VHS3Q08438 ENO1YGR254W 1314 nt8.24□□□□□ -1.09
VHS3Q08438 YFR020WYFR020W 699 nt8.23□□□□□ -1.09
VHS3Q08438 CDD1YLR245C 429 nt8.23□□□□□ -1.09
VHS3Q08438 TIF3YPR163C 1311 nt8.23□□□□□ -1.09
VHS3Q08438 NDE2YDL085W 1638 nt8.22□□□□□ -1.09
VHS3Q08438 YNL140CYNL140C 570 nt8.22□□□□□ -1.09
VHS3Q08438 MEP1YGR121C 1479 nt8.21□□□□□ -1.09
VHS3Q08438 IGD1YFR017C 588 nt8.21□□□□□ -1.1
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