Protein–RNA interactions for Protein: Q02284

Htr1f, 5-hydroxytryptamine receptor 1F, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htr1fQ02284 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Htr1fQ02284 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Htr1fQ02284 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Htr1fQ02284 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Htr1fQ02284 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Htr1fQ02284 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Htr1fQ02284 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Htr1fQ02284 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Htr1fQ02284 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Htr1fQ02284 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Htr1fQ02284 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Htr1fQ02284 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Htr1fQ02284 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Htr1fQ02284 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Htr1fQ02284 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Htr1fQ02284 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Htr1fQ02284 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Htr1fQ02284 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Htr1fQ02284 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Htr1fQ02284 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Htr1fQ02284 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Htr1fQ02284 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Htr1fQ02284 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Htr1fQ02284 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Htr1fQ02284 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Htr1fQ02284 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Htr1fQ02284 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Htr1fQ02284 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Htr1fQ02284 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Htr1fQ02284 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Htr1fQ02284 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Htr1fQ02284 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Htr1fQ02284 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Htr1fQ02284 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Htr1fQ02284 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Htr1fQ02284 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Htr1fQ02284 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Htr1fQ02284 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Htr1fQ02284 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Htr1fQ02284 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Htr1fQ02284 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Htr1fQ02284 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Htr1fQ02284 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Htr1fQ02284 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Htr1fQ02284 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Htr1fQ02284 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Htr1fQ02284 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Htr1fQ02284 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Htr1fQ02284 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Htr1fQ02284 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Htr1fQ02284 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Htr1fQ02284 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Htr1fQ02284 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Htr1fQ02284 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Htr1fQ02284 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Htr1fQ02284 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Htr1fQ02284 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Htr1fQ02284 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Htr1fQ02284 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Htr1fQ02284 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Htr1fQ02284 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Htr1fQ02284 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Htr1fQ02284 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Htr1fQ02284 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Htr1fQ02284 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Htr1fQ02284 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Htr1fQ02284 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Htr1fQ02284 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Htr1fQ02284 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Htr1fQ02284 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Htr1fQ02284 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Htr1fQ02284 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Htr1fQ02284 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Htr1fQ02284 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Htr1fQ02284 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Htr1fQ02284 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Htr1fQ02284 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Htr1fQ02284 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Htr1fQ02284 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Htr1fQ02284 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Htr1fQ02284 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Htr1fQ02284 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Htr1fQ02284 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Htr1fQ02284 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Htr1fQ02284 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Htr1fQ02284 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Htr1fQ02284 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Htr1fQ02284 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Htr1fQ02284 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Htr1fQ02284 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Htr1fQ02284 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Htr1fQ02284 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Htr1fQ02284 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Htr1fQ02284 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Htr1fQ02284 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Htr1fQ02284 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Htr1fQ02284 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Htr1fQ02284 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Htr1fQ02284 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Htr1fQ02284 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms