Protein–RNA interactions for Protein: P70208

Plxna3, Plexin-A3, mousemouse

Predictions only

Length 1,872 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plxna3P70208 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Plxna3P70208 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Plxna3P70208 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Plxna3P70208 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Plxna3P70208 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Plxna3P70208 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Plxna3P70208 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Plxna3P70208 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Plxna3P70208 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Plxna3P70208 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Plxna3P70208 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Plxna3P70208 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Plxna3P70208 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Plxna3P70208 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Plxna3P70208 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Plxna3P70208 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Plxna3P70208 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Plxna3P70208 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Plxna3P70208 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Plxna3P70208 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Plxna3P70208 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Plxna3P70208 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Plxna3P70208 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Plxna3P70208 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Plxna3P70208 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Plxna3P70208 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Plxna3P70208 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Plxna3P70208 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Plxna3P70208 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Plxna3P70208 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Plxna3P70208 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Plxna3P70208 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Plxna3P70208 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Plxna3P70208 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Plxna3P70208 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Plxna3P70208 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Plxna3P70208 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Plxna3P70208 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Plxna3P70208 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Plxna3P70208 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Plxna3P70208 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Plxna3P70208 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Plxna3P70208 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Plxna3P70208 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Plxna3P70208 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Plxna3P70208 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Plxna3P70208 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Plxna3P70208 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Plxna3P70208 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Plxna3P70208 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Plxna3P70208 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Plxna3P70208 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Plxna3P70208 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Plxna3P70208 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Plxna3P70208 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Plxna3P70208 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Plxna3P70208 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Plxna3P70208 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Plxna3P70208 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Plxna3P70208 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Plxna3P70208 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Plxna3P70208 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Plxna3P70208 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Plxna3P70208 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Plxna3P70208 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Plxna3P70208 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Plxna3P70208 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Plxna3P70208 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Plxna3P70208 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Plxna3P70208 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Plxna3P70208 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Plxna3P70208 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Plxna3P70208 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Plxna3P70208 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Plxna3P70208 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Plxna3P70208 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Plxna3P70208 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Plxna3P70208 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Plxna3P70208 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Plxna3P70208 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Plxna3P70208 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Plxna3P70208 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Plxna3P70208 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Plxna3P70208 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Plxna3P70208 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Plxna3P70208 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Plxna3P70208 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Plxna3P70208 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Plxna3P70208 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Plxna3P70208 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Plxna3P70208 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Plxna3P70208 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Plxna3P70208 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Plxna3P70208 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Plxna3P70208 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Plxna3P70208 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Plxna3P70208 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Plxna3P70208 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Plxna3P70208 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Plxna3P70208 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.5 ms