Protein–RNA interactions for Protein: P68033

Actc1, Actin, alpha cardiac muscle 1, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actc1P68033 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Actc1P68033 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Actc1P68033 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Actc1P68033 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Actc1P68033 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Actc1P68033 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Actc1P68033 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Actc1P68033 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Actc1P68033 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Actc1P68033 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Actc1P68033 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Actc1P68033 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Actc1P68033 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Actc1P68033 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Actc1P68033 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Actc1P68033 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Actc1P68033 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Actc1P68033 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Actc1P68033 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Actc1P68033 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Actc1P68033 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Actc1P68033 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Actc1P68033 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Actc1P68033 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Actc1P68033 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Actc1P68033 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Actc1P68033 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Actc1P68033 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Actc1P68033 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Actc1P68033 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Actc1P68033 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Actc1P68033 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Actc1P68033 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Actc1P68033 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Actc1P68033 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Actc1P68033 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Actc1P68033 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Actc1P68033 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Actc1P68033 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Actc1P68033 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Actc1P68033 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Actc1P68033 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Actc1P68033 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Actc1P68033 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Actc1P68033 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Actc1P68033 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Actc1P68033 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Actc1P68033 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Actc1P68033 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Actc1P68033 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Actc1P68033 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Actc1P68033 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Actc1P68033 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Actc1P68033 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Actc1P68033 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Actc1P68033 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Actc1P68033 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Actc1P68033 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Actc1P68033 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Actc1P68033 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Actc1P68033 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Actc1P68033 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Actc1P68033 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Actc1P68033 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Actc1P68033 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Actc1P68033 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Actc1P68033 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Actc1P68033 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Actc1P68033 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Actc1P68033 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Actc1P68033 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Actc1P68033 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Actc1P68033 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Actc1P68033 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Actc1P68033 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Actc1P68033 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Actc1P68033 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Actc1P68033 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Actc1P68033 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Actc1P68033 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Actc1P68033 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Actc1P68033 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Actc1P68033 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Actc1P68033 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Actc1P68033 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Actc1P68033 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Actc1P68033 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Actc1P68033 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Actc1P68033 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Actc1P68033 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Actc1P68033 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Actc1P68033 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Actc1P68033 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Actc1P68033 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Actc1P68033 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Actc1P68033 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Actc1P68033 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Actc1P68033 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Actc1P68033 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Actc1P68033 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.7 ms