Protein–RNA interactions for Protein: P62737

Acta2, Actin, aortic smooth muscle, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acta2P62737 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Acta2P62737 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Acta2P62737 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Acta2P62737 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Acta2P62737 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Acta2P62737 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Acta2P62737 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Acta2P62737 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Acta2P62737 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Acta2P62737 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Acta2P62737 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Acta2P62737 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Acta2P62737 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Acta2P62737 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Acta2P62737 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Acta2P62737 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Acta2P62737 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Acta2P62737 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Acta2P62737 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Acta2P62737 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Acta2P62737 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Acta2P62737 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Acta2P62737 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Acta2P62737 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Acta2P62737 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Acta2P62737 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Acta2P62737 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Acta2P62737 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Acta2P62737 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Acta2P62737 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Acta2P62737 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Acta2P62737 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Acta2P62737 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Acta2P62737 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Acta2P62737 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Acta2P62737 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Acta2P62737 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Acta2P62737 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Acta2P62737 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Acta2P62737 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Acta2P62737 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Acta2P62737 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Acta2P62737 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Acta2P62737 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Acta2P62737 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Acta2P62737 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Acta2P62737 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Acta2P62737 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Acta2P62737 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Acta2P62737 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Acta2P62737 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Acta2P62737 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Acta2P62737 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Acta2P62737 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Acta2P62737 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Acta2P62737 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Acta2P62737 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Acta2P62737 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Acta2P62737 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Acta2P62737 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Acta2P62737 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Acta2P62737 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Acta2P62737 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Acta2P62737 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Acta2P62737 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Acta2P62737 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Acta2P62737 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Acta2P62737 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Acta2P62737 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Acta2P62737 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Acta2P62737 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Acta2P62737 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Acta2P62737 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Acta2P62737 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Acta2P62737 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Acta2P62737 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Acta2P62737 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Acta2P62737 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Acta2P62737 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Acta2P62737 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Acta2P62737 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Acta2P62737 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Acta2P62737 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Acta2P62737 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Acta2P62737 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Acta2P62737 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Acta2P62737 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Acta2P62737 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Acta2P62737 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Acta2P62737 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Acta2P62737 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Acta2P62737 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Acta2P62737 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Acta2P62737 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Acta2P62737 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Acta2P62737 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Acta2P62737 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Acta2P62737 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Acta2P62737 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Acta2P62737 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms