Protein–RNA interactions for Protein: P62281

Rps11, 40S ribosomal protein S11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps11P62281 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rps11P62281 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rps11P62281 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rps11P62281 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rps11P62281 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rps11P62281 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rps11P62281 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rps11P62281 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rps11P62281 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rps11P62281 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Rps11P62281 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rps11P62281 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rps11P62281 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rps11P62281 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rps11P62281 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rps11P62281 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rps11P62281 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Rps11P62281 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rps11P62281 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rps11P62281 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Rps11P62281 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rps11P62281 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rps11P62281 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rps11P62281 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rps11P62281 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rps11P62281 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rps11P62281 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rps11P62281 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rps11P62281 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rps11P62281 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rps11P62281 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rps11P62281 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rps11P62281 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rps11P62281 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rps11P62281 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rps11P62281 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rps11P62281 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rps11P62281 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rps11P62281 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rps11P62281 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rps11P62281 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rps11P62281 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rps11P62281 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rps11P62281 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rps11P62281 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rps11P62281 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rps11P62281 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rps11P62281 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rps11P62281 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rps11P62281 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rps11P62281 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rps11P62281 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rps11P62281 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rps11P62281 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rps11P62281 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rps11P62281 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rps11P62281 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rps11P62281 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rps11P62281 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rps11P62281 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rps11P62281 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rps11P62281 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rps11P62281 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rps11P62281 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rps11P62281 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rps11P62281 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rps11P62281 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rps11P62281 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rps11P62281 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rps11P62281 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rps11P62281 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rps11P62281 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rps11P62281 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rps11P62281 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rps11P62281 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rps11P62281 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rps11P62281 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rps11P62281 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rps11P62281 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rps11P62281 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rps11P62281 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rps11P62281 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rps11P62281 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rps11P62281 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rps11P62281 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rps11P62281 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rps11P62281 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rps11P62281 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rps11P62281 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rps11P62281 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rps11P62281 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rps11P62281 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rps11P62281 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rps11P62281 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rps11P62281 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rps11P62281 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rps11P62281 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rps11P62281 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rps11P62281 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rps11P62281 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms