Protein–RNA interactions for Protein: P61222

Abce1, ATP-binding cassette sub-family E member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abce1P61222 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Abce1P61222 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Abce1P61222 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Abce1P61222 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Abce1P61222 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Abce1P61222 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Abce1P61222 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Abce1P61222 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Abce1P61222 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Abce1P61222 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Abce1P61222 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Abce1P61222 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Abce1P61222 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Abce1P61222 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Abce1P61222 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Abce1P61222 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Abce1P61222 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Abce1P61222 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Abce1P61222 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Abce1P61222 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Abce1P61222 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Abce1P61222 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Abce1P61222 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Abce1P61222 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Abce1P61222 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Abce1P61222 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Abce1P61222 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Abce1P61222 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Abce1P61222 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Abce1P61222 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Abce1P61222 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Abce1P61222 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Abce1P61222 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Abce1P61222 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Abce1P61222 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Abce1P61222 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Abce1P61222 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Abce1P61222 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Abce1P61222 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Abce1P61222 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Abce1P61222 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Abce1P61222 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Abce1P61222 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Abce1P61222 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Abce1P61222 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Abce1P61222 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Abce1P61222 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Abce1P61222 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Abce1P61222 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Abce1P61222 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Abce1P61222 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Abce1P61222 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Abce1P61222 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Abce1P61222 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Abce1P61222 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Abce1P61222 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Abce1P61222 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Abce1P61222 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Abce1P61222 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Abce1P61222 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Abce1P61222 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Abce1P61222 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Abce1P61222 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Abce1P61222 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Abce1P61222 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Abce1P61222 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Abce1P61222 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Abce1P61222 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Abce1P61222 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Abce1P61222 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Abce1P61222 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Abce1P61222 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Abce1P61222 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Abce1P61222 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Abce1P61222 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Abce1P61222 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Abce1P61222 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Abce1P61222 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Abce1P61222 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Abce1P61222 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Abce1P61222 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Abce1P61222 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Abce1P61222 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Abce1P61222 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Abce1P61222 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Abce1P61222 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Abce1P61222 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Abce1P61222 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Abce1P61222 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Abce1P61222 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Abce1P61222 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Abce1P61222 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Abce1P61222 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Abce1P61222 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Abce1P61222 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Abce1P61222 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Abce1P61222 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Abce1P61222 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Abce1P61222 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Abce1P61222 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms