Protein–RNA interactions for Protein: P55258

Rab8a, Ras-related protein Rab-8A, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab8aP55258 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rab8aP55258 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rab8aP55258 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rab8aP55258 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rab8aP55258 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rab8aP55258 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rab8aP55258 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rab8aP55258 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rab8aP55258 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rab8aP55258 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rab8aP55258 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rab8aP55258 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rab8aP55258 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rab8aP55258 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rab8aP55258 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rab8aP55258 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rab8aP55258 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rab8aP55258 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rab8aP55258 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rab8aP55258 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rab8aP55258 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rab8aP55258 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rab8aP55258 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rab8aP55258 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rab8aP55258 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rab8aP55258 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rab8aP55258 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rab8aP55258 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rab8aP55258 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rab8aP55258 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rab8aP55258 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rab8aP55258 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rab8aP55258 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rab8aP55258 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rab8aP55258 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rab8aP55258 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rab8aP55258 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Rab8aP55258 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Rab8aP55258 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rab8aP55258 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rab8aP55258 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rab8aP55258 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rab8aP55258 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rab8aP55258 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rab8aP55258 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rab8aP55258 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rab8aP55258 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rab8aP55258 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rab8aP55258 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rab8aP55258 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rab8aP55258 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rab8aP55258 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rab8aP55258 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rab8aP55258 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rab8aP55258 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rab8aP55258 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rab8aP55258 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rab8aP55258 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rab8aP55258 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rab8aP55258 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rab8aP55258 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rab8aP55258 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rab8aP55258 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rab8aP55258 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rab8aP55258 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rab8aP55258 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rab8aP55258 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rab8aP55258 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rab8aP55258 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rab8aP55258 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Rab8aP55258 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Rab8aP55258 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rab8aP55258 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rab8aP55258 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rab8aP55258 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rab8aP55258 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rab8aP55258 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rab8aP55258 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rab8aP55258 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rab8aP55258 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rab8aP55258 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rab8aP55258 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rab8aP55258 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rab8aP55258 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rab8aP55258 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rab8aP55258 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rab8aP55258 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rab8aP55258 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rab8aP55258 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rab8aP55258 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rab8aP55258 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rab8aP55258 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rab8aP55258 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rab8aP55258 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rab8aP55258 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rab8aP55258 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rab8aP55258 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rab8aP55258 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rab8aP55258 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rab8aP55258 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms