Protein–RNA interactions for Protein: P54726

Rad23a, UV excision repair protein RAD23 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23aP54726 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Rad23aP54726 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Rad23aP54726 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Rad23aP54726 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rad23aP54726 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rad23aP54726 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rad23aP54726 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rad23aP54726 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rad23aP54726 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rad23aP54726 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rad23aP54726 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rad23aP54726 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rad23aP54726 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rad23aP54726 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Rad23aP54726 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rad23aP54726 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rad23aP54726 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rad23aP54726 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rad23aP54726 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Rad23aP54726 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Rad23aP54726 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Rad23aP54726 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Rad23aP54726 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rad23aP54726 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rad23aP54726 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rad23aP54726 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rad23aP54726 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rad23aP54726 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rad23aP54726 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rad23aP54726 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rad23aP54726 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rad23aP54726 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rad23aP54726 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rad23aP54726 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rad23aP54726 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rad23aP54726 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rad23aP54726 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rad23aP54726 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rad23aP54726 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rad23aP54726 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rad23aP54726 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rad23aP54726 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rad23aP54726 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rad23aP54726 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rad23aP54726 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rad23aP54726 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rad23aP54726 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rad23aP54726 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rad23aP54726 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rad23aP54726 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rad23aP54726 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rad23aP54726 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rad23aP54726 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rad23aP54726 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rad23aP54726 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rad23aP54726 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rad23aP54726 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rad23aP54726 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rad23aP54726 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rad23aP54726 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rad23aP54726 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rad23aP54726 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rad23aP54726 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rad23aP54726 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rad23aP54726 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rad23aP54726 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rad23aP54726 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rad23aP54726 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rad23aP54726 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rad23aP54726 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rad23aP54726 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rad23aP54726 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rad23aP54726 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rad23aP54726 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rad23aP54726 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rad23aP54726 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Rad23aP54726 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Rad23aP54726 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Rad23aP54726 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rad23aP54726 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rad23aP54726 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rad23aP54726 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rad23aP54726 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Rad23aP54726 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rad23aP54726 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rad23aP54726 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rad23aP54726 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rad23aP54726 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rad23aP54726 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rad23aP54726 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rad23aP54726 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rad23aP54726 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Rad23aP54726 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rad23aP54726 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rad23aP54726 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rad23aP54726 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rad23aP54726 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rad23aP54726 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rad23aP54726 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rad23aP54726 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 144 ms