Protein–RNA interactions for Protein: P50992

Atp4b, Potassium-transporting ATPase subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp4bP50992 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atp4bP50992 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Atp4bP50992 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Atp4bP50992 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atp4bP50992 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atp4bP50992 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atp4bP50992 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atp4bP50992 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atp4bP50992 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atp4bP50992 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atp4bP50992 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atp4bP50992 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atp4bP50992 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atp4bP50992 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atp4bP50992 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atp4bP50992 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atp4bP50992 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atp4bP50992 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atp4bP50992 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Atp4bP50992 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atp4bP50992 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atp4bP50992 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atp4bP50992 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atp4bP50992 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atp4bP50992 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atp4bP50992 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atp4bP50992 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atp4bP50992 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atp4bP50992 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atp4bP50992 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atp4bP50992 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atp4bP50992 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atp4bP50992 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Atp4bP50992 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atp4bP50992 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atp4bP50992 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atp4bP50992 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atp4bP50992 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atp4bP50992 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Atp4bP50992 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Atp4bP50992 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Atp4bP50992 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Atp4bP50992 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Atp4bP50992 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atp4bP50992 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atp4bP50992 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atp4bP50992 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atp4bP50992 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atp4bP50992 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Atp4bP50992 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atp4bP50992 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atp4bP50992 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atp4bP50992 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atp4bP50992 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atp4bP50992 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atp4bP50992 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atp4bP50992 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atp4bP50992 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atp4bP50992 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atp4bP50992 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atp4bP50992 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atp4bP50992 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atp4bP50992 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atp4bP50992 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atp4bP50992 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atp4bP50992 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atp4bP50992 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atp4bP50992 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atp4bP50992 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atp4bP50992 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atp4bP50992 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atp4bP50992 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atp4bP50992 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atp4bP50992 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atp4bP50992 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atp4bP50992 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atp4bP50992 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atp4bP50992 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atp4bP50992 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Atp4bP50992 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Atp4bP50992 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atp4bP50992 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atp4bP50992 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atp4bP50992 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atp4bP50992 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atp4bP50992 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atp4bP50992 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atp4bP50992 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atp4bP50992 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atp4bP50992 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atp4bP50992 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atp4bP50992 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atp4bP50992 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atp4bP50992 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atp4bP50992 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atp4bP50992 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atp4bP50992 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atp4bP50992 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Atp4bP50992 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Atp4bP50992 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.7 ms