Protein–RNA interactions for Protein: P50396

Gdi1, Rab GDP dissociation inhibitor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdi1P50396 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Gdi1P50396 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gdi1P50396 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gdi1P50396 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Gdi1P50396 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gdi1P50396 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gdi1P50396 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gdi1P50396 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gdi1P50396 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gdi1P50396 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gdi1P50396 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gdi1P50396 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Gdi1P50396 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gdi1P50396 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gdi1P50396 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gdi1P50396 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gdi1P50396 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gdi1P50396 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gdi1P50396 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gdi1P50396 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gdi1P50396 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gdi1P50396 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gdi1P50396 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gdi1P50396 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gdi1P50396 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gdi1P50396 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gdi1P50396 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Gdi1P50396 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gdi1P50396 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gdi1P50396 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Gdi1P50396 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gdi1P50396 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gdi1P50396 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Gdi1P50396 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gdi1P50396 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gdi1P50396 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gdi1P50396 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gdi1P50396 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gdi1P50396 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gdi1P50396 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gdi1P50396 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gdi1P50396 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gdi1P50396 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gdi1P50396 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gdi1P50396 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gdi1P50396 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gdi1P50396 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gdi1P50396 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gdi1P50396 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gdi1P50396 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gdi1P50396 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gdi1P50396 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gdi1P50396 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Gdi1P50396 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Gdi1P50396 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Gdi1P50396 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gdi1P50396 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gdi1P50396 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
Gdi1P50396 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Gdi1P50396 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gdi1P50396 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gdi1P50396 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gdi1P50396 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gdi1P50396 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gdi1P50396 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24■■□□□ 1.43
Gdi1P50396 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gdi1P50396 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gdi1P50396 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gdi1P50396 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gdi1P50396 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gdi1P50396 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gdi1P50396 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gdi1P50396 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Gdi1P50396 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gdi1P50396 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gdi1P50396 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gdi1P50396 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gdi1P50396 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gdi1P50396 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gdi1P50396 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Gdi1P50396 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gdi1P50396 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gdi1P50396 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gdi1P50396 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gdi1P50396 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gdi1P50396 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gdi1P50396 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gdi1P50396 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gdi1P50396 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gdi1P50396 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gdi1P50396 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gdi1P50396 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gdi1P50396 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gdi1P50396 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gdi1P50396 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gdi1P50396 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gdi1P50396 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gdi1P50396 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Gdi1P50396 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Gdi1P50396 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms