Protein–RNA interactions for Protein: P48678

Lmna, Prelamin-A/C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LmnaP48678 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LmnaP48678 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LmnaP48678 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
LmnaP48678 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LmnaP48678 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LmnaP48678 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LmnaP48678 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
LmnaP48678 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LmnaP48678 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LmnaP48678 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LmnaP48678 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LmnaP48678 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LmnaP48678 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LmnaP48678 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LmnaP48678 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LmnaP48678 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LmnaP48678 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LmnaP48678 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LmnaP48678 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LmnaP48678 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LmnaP48678 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LmnaP48678 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LmnaP48678 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LmnaP48678 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LmnaP48678 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
LmnaP48678 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LmnaP48678 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LmnaP48678 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LmnaP48678 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LmnaP48678 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LmnaP48678 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LmnaP48678 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
LmnaP48678 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LmnaP48678 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LmnaP48678 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LmnaP48678 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LmnaP48678 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LmnaP48678 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LmnaP48678 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LmnaP48678 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LmnaP48678 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LmnaP48678 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LmnaP48678 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LmnaP48678 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LmnaP48678 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LmnaP48678 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LmnaP48678 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LmnaP48678 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LmnaP48678 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LmnaP48678 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LmnaP48678 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LmnaP48678 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LmnaP48678 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LmnaP48678 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LmnaP48678 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LmnaP48678 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LmnaP48678 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LmnaP48678 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LmnaP48678 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LmnaP48678 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LmnaP48678 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
LmnaP48678 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LmnaP48678 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LmnaP48678 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
LmnaP48678 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LmnaP48678 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LmnaP48678 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LmnaP48678 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LmnaP48678 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LmnaP48678 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LmnaP48678 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LmnaP48678 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LmnaP48678 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LmnaP48678 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LmnaP48678 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LmnaP48678 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
LmnaP48678 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LmnaP48678 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LmnaP48678 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LmnaP48678 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LmnaP48678 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LmnaP48678 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LmnaP48678 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LmnaP48678 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LmnaP48678 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LmnaP48678 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LmnaP48678 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LmnaP48678 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LmnaP48678 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LmnaP48678 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LmnaP48678 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LmnaP48678 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LmnaP48678 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LmnaP48678 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LmnaP48678 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LmnaP48678 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LmnaP48678 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LmnaP48678 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LmnaP48678 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LmnaP48678 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms