Protein–RNA interactions for Protein: P48432

Sox2, Transcription factor SOX-2, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox2P48432 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sox2P48432 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sox2P48432 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sox2P48432 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sox2P48432 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sox2P48432 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sox2P48432 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sox2P48432 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sox2P48432 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sox2P48432 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sox2P48432 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sox2P48432 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sox2P48432 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sox2P48432 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Sox2P48432 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sox2P48432 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sox2P48432 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sox2P48432 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sox2P48432 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sox2P48432 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sox2P48432 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sox2P48432 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sox2P48432 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sox2P48432 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sox2P48432 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sox2P48432 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sox2P48432 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Sox2P48432 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sox2P48432 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Sox2P48432 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sox2P48432 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sox2P48432 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sox2P48432 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sox2P48432 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sox2P48432 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sox2P48432 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sox2P48432 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sox2P48432 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sox2P48432 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sox2P48432 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sox2P48432 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sox2P48432 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sox2P48432 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sox2P48432 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sox2P48432 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sox2P48432 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sox2P48432 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sox2P48432 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sox2P48432 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sox2P48432 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sox2P48432 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sox2P48432 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sox2P48432 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sox2P48432 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sox2P48432 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sox2P48432 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sox2P48432 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sox2P48432 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sox2P48432 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sox2P48432 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sox2P48432 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sox2P48432 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sox2P48432 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sox2P48432 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sox2P48432 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sox2P48432 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sox2P48432 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sox2P48432 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sox2P48432 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sox2P48432 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sox2P48432 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sox2P48432 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sox2P48432 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sox2P48432 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sox2P48432 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sox2P48432 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sox2P48432 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sox2P48432 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sox2P48432 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sox2P48432 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sox2P48432 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sox2P48432 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sox2P48432 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sox2P48432 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sox2P48432 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sox2P48432 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sox2P48432 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sox2P48432 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sox2P48432 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sox2P48432 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sox2P48432 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sox2P48432 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sox2P48432 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sox2P48432 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sox2P48432 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sox2P48432 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sox2P48432 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sox2P48432 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sox2P48432 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sox2P48432 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms