Protein–RNA interactions for Protein: P46718

Pdcd2, Programmed cell death protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd2P46718 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pdcd2P46718 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pdcd2P46718 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pdcd2P46718 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pdcd2P46718 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pdcd2P46718 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Pdcd2P46718 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pdcd2P46718 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pdcd2P46718 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pdcd2P46718 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pdcd2P46718 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pdcd2P46718 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pdcd2P46718 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pdcd2P46718 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pdcd2P46718 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pdcd2P46718 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pdcd2P46718 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pdcd2P46718 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pdcd2P46718 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pdcd2P46718 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pdcd2P46718 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pdcd2P46718 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pdcd2P46718 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Pdcd2P46718 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pdcd2P46718 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pdcd2P46718 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Pdcd2P46718 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pdcd2P46718 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pdcd2P46718 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pdcd2P46718 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pdcd2P46718 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pdcd2P46718 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pdcd2P46718 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pdcd2P46718 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pdcd2P46718 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pdcd2P46718 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pdcd2P46718 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pdcd2P46718 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pdcd2P46718 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pdcd2P46718 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pdcd2P46718 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pdcd2P46718 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pdcd2P46718 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pdcd2P46718 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pdcd2P46718 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pdcd2P46718 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pdcd2P46718 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pdcd2P46718 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pdcd2P46718 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pdcd2P46718 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pdcd2P46718 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pdcd2P46718 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pdcd2P46718 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pdcd2P46718 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pdcd2P46718 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pdcd2P46718 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pdcd2P46718 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pdcd2P46718 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pdcd2P46718 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pdcd2P46718 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pdcd2P46718 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pdcd2P46718 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pdcd2P46718 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pdcd2P46718 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pdcd2P46718 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pdcd2P46718 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pdcd2P46718 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pdcd2P46718 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pdcd2P46718 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pdcd2P46718 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pdcd2P46718 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pdcd2P46718 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pdcd2P46718 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pdcd2P46718 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pdcd2P46718 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pdcd2P46718 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pdcd2P46718 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pdcd2P46718 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Pdcd2P46718 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Pdcd2P46718 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Pdcd2P46718 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Pdcd2P46718 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Pdcd2P46718 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pdcd2P46718 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pdcd2P46718 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pdcd2P46718 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pdcd2P46718 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pdcd2P46718 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pdcd2P46718 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pdcd2P46718 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pdcd2P46718 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pdcd2P46718 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pdcd2P46718 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pdcd2P46718 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pdcd2P46718 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pdcd2P46718 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pdcd2P46718 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pdcd2P46718 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pdcd2P46718 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pdcd2P46718 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms