Protein–RNA interactions for Protein: P46099

Klf1, Krueppel-like factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf1P46099 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Klf1P46099 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Klf1P46099 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Klf1P46099 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Klf1P46099 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Klf1P46099 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Klf1P46099 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Klf1P46099 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Klf1P46099 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Klf1P46099 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Klf1P46099 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Klf1P46099 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Klf1P46099 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Klf1P46099 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Klf1P46099 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Klf1P46099 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Klf1P46099 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Klf1P46099 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Klf1P46099 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Klf1P46099 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Klf1P46099 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Klf1P46099 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Klf1P46099 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Klf1P46099 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Klf1P46099 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Klf1P46099 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Klf1P46099 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Klf1P46099 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Klf1P46099 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Klf1P46099 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Klf1P46099 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Klf1P46099 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Klf1P46099 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Klf1P46099 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Klf1P46099 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Klf1P46099 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Klf1P46099 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Klf1P46099 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Klf1P46099 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Klf1P46099 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Klf1P46099 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Klf1P46099 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Klf1P46099 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Klf1P46099 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Klf1P46099 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Klf1P46099 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Klf1P46099 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Klf1P46099 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Klf1P46099 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Klf1P46099 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Klf1P46099 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Klf1P46099 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Klf1P46099 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Klf1P46099 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Klf1P46099 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Klf1P46099 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Klf1P46099 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Klf1P46099 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Klf1P46099 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Klf1P46099 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Klf1P46099 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Klf1P46099 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Klf1P46099 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Klf1P46099 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Klf1P46099 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Klf1P46099 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Klf1P46099 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Klf1P46099 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Klf1P46099 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Klf1P46099 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Klf1P46099 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Klf1P46099 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Klf1P46099 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Klf1P46099 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Klf1P46099 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Klf1P46099 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Klf1P46099 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Klf1P46099 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Klf1P46099 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Klf1P46099 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Klf1P46099 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Klf1P46099 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Klf1P46099 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Klf1P46099 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Klf1P46099 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Klf1P46099 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Klf1P46099 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Klf1P46099 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Klf1P46099 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Klf1P46099 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Klf1P46099 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Klf1P46099 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Klf1P46099 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Klf1P46099 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Klf1P46099 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Klf1P46099 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Klf1P46099 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Klf1P46099 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Klf1P46099 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Klf1P46099 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms