Protein–RNA interactions for Protein: P37913

Lig1, DNA ligase 1, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig1P37913 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Lig1P37913 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Lig1P37913 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Lig1P37913 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Lig1P37913 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Lig1P37913 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Lig1P37913 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Lig1P37913 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Lig1P37913 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Lig1P37913 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Lig1P37913 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Lig1P37913 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Lig1P37913 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Lig1P37913 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Lig1P37913 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Lig1P37913 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Lig1P37913 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Lig1P37913 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Lig1P37913 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Lig1P37913 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Lig1P37913 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Lig1P37913 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Lig1P37913 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Lig1P37913 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Lig1P37913 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Lig1P37913 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Lig1P37913 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Lig1P37913 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Lig1P37913 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Lig1P37913 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Lig1P37913 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Lig1P37913 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Lig1P37913 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Lig1P37913 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Lig1P37913 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Lig1P37913 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Lig1P37913 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Lig1P37913 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Lig1P37913 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Lig1P37913 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Lig1P37913 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Lig1P37913 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Lig1P37913 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Lig1P37913 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Lig1P37913 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Lig1P37913 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Lig1P37913 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Lig1P37913 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Lig1P37913 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Lig1P37913 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Lig1P37913 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Lig1P37913 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Lig1P37913 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Lig1P37913 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Lig1P37913 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Lig1P37913 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Lig1P37913 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Lig1P37913 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Lig1P37913 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Lig1P37913 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Lig1P37913 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Lig1P37913 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Lig1P37913 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Lig1P37913 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Lig1P37913 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Lig1P37913 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Lig1P37913 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Lig1P37913 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Lig1P37913 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Lig1P37913 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Lig1P37913 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Lig1P37913 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Lig1P37913 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Lig1P37913 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Lig1P37913 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Lig1P37913 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Lig1P37913 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Lig1P37913 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Lig1P37913 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Lig1P37913 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Lig1P37913 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Lig1P37913 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Lig1P37913 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Lig1P37913 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Lig1P37913 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Lig1P37913 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Lig1P37913 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Lig1P37913 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Lig1P37913 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Lig1P37913 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Lig1P37913 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Lig1P37913 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Lig1P37913 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Lig1P37913 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Lig1P37913 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Lig1P37913 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Lig1P37913 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Lig1P37913 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Lig1P37913 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Lig1P37913 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms