Protein–RNA interactions for Protein: P35546

Ret, Proto-oncogene tyrosine-protein kinase receptor Ret, mousemouse

Predictions only

Length 1,115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RetP35546 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RetP35546 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RetP35546 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RetP35546 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RetP35546 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RetP35546 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RetP35546 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RetP35546 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RetP35546 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RetP35546 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RetP35546 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RetP35546 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RetP35546 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RetP35546 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RetP35546 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RetP35546 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RetP35546 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RetP35546 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RetP35546 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RetP35546 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RetP35546 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RetP35546 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RetP35546 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RetP35546 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RetP35546 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RetP35546 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RetP35546 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RetP35546 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RetP35546 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RetP35546 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RetP35546 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RetP35546 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RetP35546 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RetP35546 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RetP35546 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RetP35546 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RetP35546 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RetP35546 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RetP35546 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RetP35546 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RetP35546 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RetP35546 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RetP35546 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RetP35546 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RetP35546 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RetP35546 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RetP35546 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RetP35546 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RetP35546 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RetP35546 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RetP35546 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RetP35546 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RetP35546 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RetP35546 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RetP35546 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RetP35546 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RetP35546 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RetP35546 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RetP35546 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RetP35546 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RetP35546 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RetP35546 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RetP35546 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RetP35546 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RetP35546 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RetP35546 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RetP35546 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RetP35546 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RetP35546 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RetP35546 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RetP35546 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RetP35546 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RetP35546 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RetP35546 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RetP35546 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RetP35546 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RetP35546 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RetP35546 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RetP35546 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RetP35546 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RetP35546 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RetP35546 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RetP35546 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RetP35546 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RetP35546 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RetP35546 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RetP35546 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RetP35546 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RetP35546 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
RetP35546 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RetP35546 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RetP35546 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RetP35546 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RetP35546 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RetP35546 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RetP35546 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RetP35546 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RetP35546 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RetP35546 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RetP35546 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 508.9 ms