Protein–RNA interactions for Protein: P35235

Ptpn11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn11P35235 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ptpn11P35235 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ptpn11P35235 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ptpn11P35235 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ptpn11P35235 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ptpn11P35235 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ptpn11P35235 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ptpn11P35235 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ptpn11P35235 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ptpn11P35235 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ptpn11P35235 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ptpn11P35235 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ptpn11P35235 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Ptpn11P35235 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ptpn11P35235 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ptpn11P35235 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Ptpn11P35235 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ptpn11P35235 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Ptpn11P35235 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ptpn11P35235 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ptpn11P35235 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Ptpn11P35235 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Ptpn11P35235 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ptpn11P35235 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ptpn11P35235 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ptpn11P35235 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ptpn11P35235 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ptpn11P35235 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ptpn11P35235 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ptpn11P35235 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ptpn11P35235 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ptpn11P35235 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ptpn11P35235 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Ptpn11P35235 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ptpn11P35235 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ptpn11P35235 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ptpn11P35235 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ptpn11P35235 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Ptpn11P35235 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Ptpn11P35235 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ptpn11P35235 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ptpn11P35235 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ptpn11P35235 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ptpn11P35235 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ptpn11P35235 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ptpn11P35235 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ptpn11P35235 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ptpn11P35235 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ptpn11P35235 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ptpn11P35235 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ptpn11P35235 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ptpn11P35235 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ptpn11P35235 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ptpn11P35235 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ptpn11P35235 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ptpn11P35235 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ptpn11P35235 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ptpn11P35235 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ptpn11P35235 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ptpn11P35235 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ptpn11P35235 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ptpn11P35235 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ptpn11P35235 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Ptpn11P35235 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ptpn11P35235 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ptpn11P35235 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ptpn11P35235 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ptpn11P35235 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ptpn11P35235 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ptpn11P35235 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ptpn11P35235 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ptpn11P35235 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ptpn11P35235 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ptpn11P35235 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ptpn11P35235 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Ptpn11P35235 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ptpn11P35235 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ptpn11P35235 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ptpn11P35235 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ptpn11P35235 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ptpn11P35235 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Ptpn11P35235 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Ptpn11P35235 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ptpn11P35235 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ptpn11P35235 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ptpn11P35235 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Ptpn11P35235 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ptpn11P35235 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ptpn11P35235 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ptpn11P35235 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ptpn11P35235 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ptpn11P35235 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ptpn11P35235 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ptpn11P35235 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ptpn11P35235 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ptpn11P35235 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Ptpn11P35235 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ptpn11P35235 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ptpn11P35235 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ptpn11P35235 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms