Protein–RNA interactions for Protein: P29974

Cnga1, cGMP-gated cation channel alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga1P29974 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
Cnga1P29974 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Cnga1P29974 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC33.07■■■□□ 2.88
Cnga1P29974 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
Cnga1P29974 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC33.06■■■□□ 2.88
Cnga1P29974 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Cnga1P29974 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC33.05■■■□□ 2.88
Cnga1P29974 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Cnga1P29974 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.04■■■□□ 2.88
Cnga1P29974 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Cnga1P29974 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Cnga1P29974 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Cnga1P29974 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Cnga1P29974 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
Cnga1P29974 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Cnga1P29974 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Cnga1P29974 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Cnga1P29974 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Cnga1P29974 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Cnga1P29974 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
Cnga1P29974 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Cnga1P29974 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
Cnga1P29974 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Cnga1P29974 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Cnga1P29974 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Cnga1P29974 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Cnga1P29974 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Cnga1P29974 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Cnga1P29974 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC32.9■■■□□ 2.86
Cnga1P29974 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Cnga1P29974 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
Cnga1P29974 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Cnga1P29974 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
Cnga1P29974 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Cnga1P29974 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Cnga1P29974 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC32.86■■■□□ 2.85
Cnga1P29974 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Cnga1P29974 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Cnga1P29974 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
Cnga1P29974 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Cnga1P29974 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Cnga1P29974 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
Cnga1P29974 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Cnga1P29974 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Cnga1P29974 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
Cnga1P29974 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Cnga1P29974 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC32.78■■■□□ 2.84
Cnga1P29974 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Cnga1P29974 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Cnga1P29974 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Cnga1P29974 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.83
Cnga1P29974 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Cnga1P29974 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
Cnga1P29974 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
Cnga1P29974 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Cnga1P29974 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Cnga1P29974 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
Cnga1P29974 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Cnga1P29974 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Cnga1P29974 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC32.7■■■□□ 2.83
Cnga1P29974 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.82
Cnga1P29974 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
Cnga1P29974 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC32.69■■■□□ 2.82
Cnga1P29974 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
Cnga1P29974 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Cnga1P29974 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
Cnga1P29974 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
Cnga1P29974 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
Cnga1P29974 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC32.68■■■□□ 2.82
Cnga1P29974 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
Cnga1P29974 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Cnga1P29974 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Cnga1P29974 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Cnga1P29974 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Cnga1P29974 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Cnga1P29974 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Cnga1P29974 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC32.64■■■□□ 2.82
Cnga1P29974 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
Cnga1P29974 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Cnga1P29974 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Cnga1P29974 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
Cnga1P29974 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Cnga1P29974 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Cnga1P29974 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Cnga1P29974 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
Cnga1P29974 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
Cnga1P29974 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Cnga1P29974 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Cnga1P29974 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Cnga1P29974 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Cnga1P29974 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
Cnga1P29974 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
Cnga1P29974 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Cnga1P29974 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
Cnga1P29974 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
Cnga1P29974 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Cnga1P29974 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
Cnga1P29974 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Cnga1P29974 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
Cnga1P29974 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms