Protein–RNA interactions for Protein: P28867

Prkcd, Protein kinase C delta type, mousemouse

Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcdP28867 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PrkcdP28867 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PrkcdP28867 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PrkcdP28867 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PrkcdP28867 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PrkcdP28867 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PrkcdP28867 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PrkcdP28867 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PrkcdP28867 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PrkcdP28867 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PrkcdP28867 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PrkcdP28867 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PrkcdP28867 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PrkcdP28867 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PrkcdP28867 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PrkcdP28867 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PrkcdP28867 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PrkcdP28867 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PrkcdP28867 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PrkcdP28867 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PrkcdP28867 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PrkcdP28867 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PrkcdP28867 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PrkcdP28867 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PrkcdP28867 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PrkcdP28867 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PrkcdP28867 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PrkcdP28867 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PrkcdP28867 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PrkcdP28867 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PrkcdP28867 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PrkcdP28867 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PrkcdP28867 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PrkcdP28867 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PrkcdP28867 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PrkcdP28867 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PrkcdP28867 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PrkcdP28867 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PrkcdP28867 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PrkcdP28867 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PrkcdP28867 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PrkcdP28867 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PrkcdP28867 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PrkcdP28867 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PrkcdP28867 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PrkcdP28867 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PrkcdP28867 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PrkcdP28867 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PrkcdP28867 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PrkcdP28867 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PrkcdP28867 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PrkcdP28867 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PrkcdP28867 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PrkcdP28867 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PrkcdP28867 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PrkcdP28867 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PrkcdP28867 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PrkcdP28867 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PrkcdP28867 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PrkcdP28867 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PrkcdP28867 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PrkcdP28867 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PrkcdP28867 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PrkcdP28867 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PrkcdP28867 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PrkcdP28867 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PrkcdP28867 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PrkcdP28867 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PrkcdP28867 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PrkcdP28867 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PrkcdP28867 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PrkcdP28867 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PrkcdP28867 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PrkcdP28867 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PrkcdP28867 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PrkcdP28867 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PrkcdP28867 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PrkcdP28867 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PrkcdP28867 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PrkcdP28867 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PrkcdP28867 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PrkcdP28867 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PrkcdP28867 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PrkcdP28867 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PrkcdP28867 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PrkcdP28867 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PrkcdP28867 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PrkcdP28867 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PrkcdP28867 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PrkcdP28867 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PrkcdP28867 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PrkcdP28867 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PrkcdP28867 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PrkcdP28867 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PrkcdP28867 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PrkcdP28867 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PrkcdP28867 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PrkcdP28867 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PrkcdP28867 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PrkcdP28867 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms