Protein–RNA interactions for Protein: P28660

Nckap1, Nck-associated protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nckap1P28660 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Nckap1P28660 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nckap1P28660 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nckap1P28660 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nckap1P28660 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nckap1P28660 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nckap1P28660 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nckap1P28660 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nckap1P28660 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nckap1P28660 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nckap1P28660 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nckap1P28660 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nckap1P28660 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Nckap1P28660 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Nckap1P28660 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nckap1P28660 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nckap1P28660 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nckap1P28660 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nckap1P28660 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nckap1P28660 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nckap1P28660 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nckap1P28660 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nckap1P28660 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nckap1P28660 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Nckap1P28660 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nckap1P28660 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nckap1P28660 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nckap1P28660 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nckap1P28660 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nckap1P28660 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nckap1P28660 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nckap1P28660 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nckap1P28660 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nckap1P28660 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nckap1P28660 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nckap1P28660 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nckap1P28660 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nckap1P28660 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nckap1P28660 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nckap1P28660 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nckap1P28660 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nckap1P28660 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nckap1P28660 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nckap1P28660 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nckap1P28660 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nckap1P28660 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nckap1P28660 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nckap1P28660 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nckap1P28660 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Nckap1P28660 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nckap1P28660 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nckap1P28660 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nckap1P28660 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nckap1P28660 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nckap1P28660 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nckap1P28660 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Nckap1P28660 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nckap1P28660 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nckap1P28660 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nckap1P28660 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Nckap1P28660 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nckap1P28660 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nckap1P28660 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nckap1P28660 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nckap1P28660 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nckap1P28660 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nckap1P28660 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nckap1P28660 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nckap1P28660 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nckap1P28660 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nckap1P28660 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nckap1P28660 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nckap1P28660 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nckap1P28660 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nckap1P28660 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Nckap1P28660 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Nckap1P28660 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nckap1P28660 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nckap1P28660 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nckap1P28660 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nckap1P28660 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nckap1P28660 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nckap1P28660 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Nckap1P28660 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nckap1P28660 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nckap1P28660 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nckap1P28660 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nckap1P28660 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nckap1P28660 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Nckap1P28660 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nckap1P28660 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nckap1P28660 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nckap1P28660 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nckap1P28660 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nckap1P28660 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nckap1P28660 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nckap1P28660 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nckap1P28660 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nckap1P28660 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nckap1P28660 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms