Protein–RNA interactions for Protein: P27808

Mgat1, Alpha-1,3-mannosyl-glycoprotein 2-beta-N-acetylglucosaminyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mgat1P27808 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Mgat1P27808 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Mgat1P27808 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Mgat1P27808 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Mgat1P27808 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Mgat1P27808 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Mgat1P27808 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Mgat1P27808 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Mgat1P27808 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Mgat1P27808 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Mgat1P27808 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Mgat1P27808 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Mgat1P27808 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Mgat1P27808 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Mgat1P27808 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Mgat1P27808 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Mgat1P27808 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Mgat1P27808 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Mgat1P27808 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Mgat1P27808 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Mgat1P27808 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Mgat1P27808 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Mgat1P27808 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Mgat1P27808 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Mgat1P27808 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Mgat1P27808 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Mgat1P27808 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Mgat1P27808 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Mgat1P27808 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Mgat1P27808 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Mgat1P27808 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Mgat1P27808 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Mgat1P27808 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Mgat1P27808 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Mgat1P27808 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Mgat1P27808 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Mgat1P27808 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Mgat1P27808 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Mgat1P27808 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Mgat1P27808 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Mgat1P27808 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Mgat1P27808 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Mgat1P27808 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Mgat1P27808 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Mgat1P27808 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Mgat1P27808 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Mgat1P27808 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Mgat1P27808 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Mgat1P27808 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Mgat1P27808 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Mgat1P27808 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Mgat1P27808 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Mgat1P27808 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Mgat1P27808 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Mgat1P27808 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Mgat1P27808 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Mgat1P27808 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Mgat1P27808 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Mgat1P27808 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Mgat1P27808 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Mgat1P27808 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Mgat1P27808 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Mgat1P27808 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Mgat1P27808 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Mgat1P27808 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Mgat1P27808 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Mgat1P27808 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Mgat1P27808 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Mgat1P27808 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Mgat1P27808 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Mgat1P27808 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Mgat1P27808 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Mgat1P27808 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Mgat1P27808 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Mgat1P27808 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Mgat1P27808 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Mgat1P27808 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Mgat1P27808 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Mgat1P27808 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Mgat1P27808 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Mgat1P27808 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Mgat1P27808 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Mgat1P27808 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Mgat1P27808 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Mgat1P27808 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Mgat1P27808 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Mgat1P27808 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Mgat1P27808 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Mgat1P27808 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Mgat1P27808 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Mgat1P27808 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Mgat1P27808 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Mgat1P27808 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Mgat1P27808 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Mgat1P27808 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Mgat1P27808 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Mgat1P27808 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Mgat1P27808 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Mgat1P27808 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Mgat1P27808 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms