Protein–RNA interactions for Protein: P22339

Gadd45b, Growth arrest and DNA damage-inducible protein GADD45 beta, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gadd45bP22339 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Gadd45bP22339 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Gadd45bP22339 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Gadd45bP22339 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Gadd45bP22339 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Gadd45bP22339 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Gadd45bP22339 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Gadd45bP22339 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Gadd45bP22339 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Gadd45bP22339 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Gadd45bP22339 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Gadd45bP22339 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Gadd45bP22339 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Gadd45bP22339 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Gadd45bP22339 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Gadd45bP22339 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Gadd45bP22339 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Gadd45bP22339 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Gadd45bP22339 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Gadd45bP22339 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Gadd45bP22339 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Gadd45bP22339 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Gadd45bP22339 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Gadd45bP22339 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Gadd45bP22339 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Gadd45bP22339 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Gadd45bP22339 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Gadd45bP22339 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Gadd45bP22339 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Gadd45bP22339 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Gadd45bP22339 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Gadd45bP22339 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Gadd45bP22339 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Gadd45bP22339 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Gadd45bP22339 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Gadd45bP22339 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Gadd45bP22339 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Gadd45bP22339 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Gadd45bP22339 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Gadd45bP22339 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Gadd45bP22339 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Gadd45bP22339 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Gadd45bP22339 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Gadd45bP22339 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Gadd45bP22339 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Gadd45bP22339 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Gadd45bP22339 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Gadd45bP22339 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Gadd45bP22339 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Gadd45bP22339 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Gadd45bP22339 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Gadd45bP22339 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Gadd45bP22339 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Gadd45bP22339 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Gadd45bP22339 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Gadd45bP22339 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Gadd45bP22339 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Gadd45bP22339 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Gadd45bP22339 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Gadd45bP22339 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Gadd45bP22339 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Gadd45bP22339 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Gadd45bP22339 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Gadd45bP22339 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Gadd45bP22339 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Gadd45bP22339 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Gadd45bP22339 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Gadd45bP22339 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Gadd45bP22339 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Gadd45bP22339 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Gadd45bP22339 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Gadd45bP22339 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Gadd45bP22339 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Gadd45bP22339 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Gadd45bP22339 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Gadd45bP22339 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Gadd45bP22339 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Gadd45bP22339 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Gadd45bP22339 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Gadd45bP22339 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Gadd45bP22339 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Gadd45bP22339 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Gadd45bP22339 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Gadd45bP22339 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Gadd45bP22339 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Gadd45bP22339 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Gadd45bP22339 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Gadd45bP22339 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Gadd45bP22339 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Gadd45bP22339 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Gadd45bP22339 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Gadd45bP22339 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Gadd45bP22339 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Gadd45bP22339 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Gadd45bP22339 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Gadd45bP22339 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Gadd45bP22339 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Gadd45bP22339 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Gadd45bP22339 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Gadd45bP22339 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms