Protein–RNA interactions for Protein: P21619

Lmnb2, Lamin-B2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmnb2P21619 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lmnb2P21619 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Lmnb2P21619 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Lmnb2P21619 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Lmnb2P21619 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Lmnb2P21619 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Lmnb2P21619 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Lmnb2P21619 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Lmnb2P21619 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Lmnb2P21619 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Lmnb2P21619 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Lmnb2P21619 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Lmnb2P21619 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Lmnb2P21619 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Lmnb2P21619 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Lmnb2P21619 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Lmnb2P21619 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Lmnb2P21619 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Lmnb2P21619 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Lmnb2P21619 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Lmnb2P21619 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Lmnb2P21619 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Lmnb2P21619 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Lmnb2P21619 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Lmnb2P21619 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Lmnb2P21619 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Lmnb2P21619 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Lmnb2P21619 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Lmnb2P21619 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Lmnb2P21619 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Lmnb2P21619 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Lmnb2P21619 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Lmnb2P21619 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Lmnb2P21619 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Lmnb2P21619 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Lmnb2P21619 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Lmnb2P21619 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Lmnb2P21619 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lmnb2P21619 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lmnb2P21619 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lmnb2P21619 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lmnb2P21619 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Lmnb2P21619 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Lmnb2P21619 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Lmnb2P21619 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Lmnb2P21619 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Lmnb2P21619 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Lmnb2P21619 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Lmnb2P21619 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Lmnb2P21619 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Lmnb2P21619 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Lmnb2P21619 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Lmnb2P21619 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Lmnb2P21619 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Lmnb2P21619 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Lmnb2P21619 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Lmnb2P21619 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Lmnb2P21619 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Lmnb2P21619 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Lmnb2P21619 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Lmnb2P21619 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Lmnb2P21619 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Lmnb2P21619 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Lmnb2P21619 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Lmnb2P21619 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Lmnb2P21619 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Lmnb2P21619 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Lmnb2P21619 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Lmnb2P21619 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Lmnb2P21619 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Lmnb2P21619 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Lmnb2P21619 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Lmnb2P21619 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Lmnb2P21619 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Lmnb2P21619 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Lmnb2P21619 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Lmnb2P21619 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Lmnb2P21619 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Lmnb2P21619 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Lmnb2P21619 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Lmnb2P21619 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Lmnb2P21619 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Lmnb2P21619 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Lmnb2P21619 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Lmnb2P21619 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Lmnb2P21619 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Lmnb2P21619 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Lmnb2P21619 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Lmnb2P21619 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Lmnb2P21619 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Lmnb2P21619 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Lmnb2P21619 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Lmnb2P21619 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Lmnb2P21619 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Lmnb2P21619 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Lmnb2P21619 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Lmnb2P21619 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Lmnb2P21619 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Lmnb2P21619 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lmnb2P21619 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.2 ms