Protein–RNA interactions for Protein: P18761

Ca6, Carbonic anhydrase 6, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ca6P18761 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ca6P18761 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ca6P18761 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ca6P18761 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ca6P18761 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ca6P18761 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ca6P18761 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ca6P18761 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ca6P18761 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ca6P18761 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ca6P18761 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ca6P18761 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ca6P18761 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ca6P18761 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ca6P18761 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ca6P18761 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ca6P18761 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ca6P18761 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ca6P18761 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ca6P18761 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ca6P18761 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ca6P18761 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ca6P18761 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ca6P18761 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ca6P18761 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ca6P18761 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ca6P18761 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ca6P18761 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ca6P18761 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ca6P18761 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ca6P18761 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ca6P18761 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ca6P18761 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ca6P18761 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ca6P18761 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ca6P18761 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ca6P18761 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ca6P18761 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ca6P18761 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ca6P18761 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ca6P18761 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ca6P18761 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ca6P18761 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ca6P18761 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ca6P18761 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ca6P18761 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ca6P18761 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Ca6P18761 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Ca6P18761 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ca6P18761 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ca6P18761 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ca6P18761 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ca6P18761 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ca6P18761 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Ca6P18761 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ca6P18761 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ca6P18761 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ca6P18761 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ca6P18761 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ca6P18761 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ca6P18761 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ca6P18761 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ca6P18761 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ca6P18761 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ca6P18761 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ca6P18761 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ca6P18761 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ca6P18761 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ca6P18761 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ca6P18761 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ca6P18761 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ca6P18761 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ca6P18761 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ca6P18761 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Ca6P18761 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ca6P18761 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ca6P18761 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ca6P18761 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ca6P18761 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ca6P18761 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ca6P18761 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ca6P18761 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ca6P18761 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ca6P18761 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ca6P18761 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ca6P18761 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ca6P18761 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ca6P18761 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ca6P18761 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ca6P18761 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ca6P18761 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ca6P18761 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ca6P18761 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ca6P18761 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ca6P18761 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ca6P18761 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ca6P18761 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ca6P18761 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ca6P18761 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ca6P18761 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms