Protein–RNA interactions for Protein: P15919

Rag1, V(D)J recombination-activating protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rag1P15919 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rag1P15919 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rag1P15919 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rag1P15919 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rag1P15919 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rag1P15919 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rag1P15919 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rag1P15919 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rag1P15919 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rag1P15919 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Rag1P15919 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rag1P15919 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rag1P15919 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rag1P15919 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rag1P15919 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rag1P15919 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rag1P15919 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rag1P15919 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rag1P15919 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rag1P15919 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rag1P15919 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rag1P15919 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rag1P15919 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rag1P15919 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rag1P15919 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rag1P15919 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rag1P15919 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rag1P15919 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rag1P15919 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rag1P15919 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rag1P15919 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rag1P15919 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rag1P15919 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rag1P15919 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rag1P15919 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Rag1P15919 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rag1P15919 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rag1P15919 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rag1P15919 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rag1P15919 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rag1P15919 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rag1P15919 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rag1P15919 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rag1P15919 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rag1P15919 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rag1P15919 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Rag1P15919 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Rag1P15919 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Rag1P15919 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rag1P15919 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rag1P15919 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rag1P15919 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rag1P15919 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rag1P15919 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rag1P15919 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rag1P15919 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rag1P15919 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rag1P15919 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rag1P15919 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Rag1P15919 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rag1P15919 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rag1P15919 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rag1P15919 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rag1P15919 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rag1P15919 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rag1P15919 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rag1P15919 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rag1P15919 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rag1P15919 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rag1P15919 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rag1P15919 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rag1P15919 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rag1P15919 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rag1P15919 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rag1P15919 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rag1P15919 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rag1P15919 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rag1P15919 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rag1P15919 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rag1P15919 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rag1P15919 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Rag1P15919 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rag1P15919 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rag1P15919 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Rag1P15919 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rag1P15919 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rag1P15919 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rag1P15919 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rag1P15919 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rag1P15919 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rag1P15919 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rag1P15919 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rag1P15919 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rag1P15919 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rag1P15919 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rag1P15919 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rag1P15919 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rag1P15919 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rag1P15919 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Rag1P15919 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms