Protein–RNA interactions for Protein: P12657

Chrm1, Muscarinic acetylcholine receptor M1, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrm1P12657 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Chrm1P12657 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Chrm1P12657 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Chrm1P12657 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Chrm1P12657 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Chrm1P12657 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Chrm1P12657 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Chrm1P12657 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Chrm1P12657 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Chrm1P12657 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Chrm1P12657 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Chrm1P12657 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Chrm1P12657 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Chrm1P12657 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Chrm1P12657 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Chrm1P12657 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Chrm1P12657 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Chrm1P12657 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Chrm1P12657 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Chrm1P12657 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Chrm1P12657 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Chrm1P12657 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Chrm1P12657 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Chrm1P12657 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Chrm1P12657 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Chrm1P12657 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Chrm1P12657 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Chrm1P12657 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Chrm1P12657 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Chrm1P12657 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Chrm1P12657 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Chrm1P12657 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Chrm1P12657 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Chrm1P12657 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Chrm1P12657 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Chrm1P12657 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Chrm1P12657 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Chrm1P12657 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Chrm1P12657 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Chrm1P12657 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Chrm1P12657 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Chrm1P12657 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Chrm1P12657 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Chrm1P12657 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Chrm1P12657 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Chrm1P12657 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Chrm1P12657 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Chrm1P12657 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Chrm1P12657 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Chrm1P12657 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Chrm1P12657 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Chrm1P12657 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Chrm1P12657 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Chrm1P12657 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Chrm1P12657 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Chrm1P12657 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Chrm1P12657 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Chrm1P12657 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Chrm1P12657 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Chrm1P12657 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Chrm1P12657 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Chrm1P12657 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Chrm1P12657 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Chrm1P12657 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Chrm1P12657 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Chrm1P12657 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Chrm1P12657 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Chrm1P12657 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Chrm1P12657 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Chrm1P12657 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Chrm1P12657 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Chrm1P12657 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Chrm1P12657 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Chrm1P12657 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Chrm1P12657 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Chrm1P12657 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Chrm1P12657 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Chrm1P12657 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Chrm1P12657 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Chrm1P12657 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Chrm1P12657 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Chrm1P12657 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Chrm1P12657 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Chrm1P12657 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Chrm1P12657 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Chrm1P12657 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Chrm1P12657 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Chrm1P12657 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Chrm1P12657 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Chrm1P12657 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Chrm1P12657 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Chrm1P12657 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Chrm1P12657 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Chrm1P12657 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Chrm1P12657 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Chrm1P12657 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Chrm1P12657 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Chrm1P12657 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Chrm1P12657 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Chrm1P12657 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms