Protein–RNA interactions for Protein: P11725

Otc, Ornithine carbamoyltransferase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtcP11725 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
OtcP11725 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
OtcP11725 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
OtcP11725 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
OtcP11725 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
OtcP11725 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
OtcP11725 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
OtcP11725 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
OtcP11725 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
OtcP11725 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
OtcP11725 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
OtcP11725 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
OtcP11725 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
OtcP11725 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
OtcP11725 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
OtcP11725 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
OtcP11725 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
OtcP11725 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
OtcP11725 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
OtcP11725 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
OtcP11725 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
OtcP11725 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
OtcP11725 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
OtcP11725 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
OtcP11725 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
OtcP11725 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
OtcP11725 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
OtcP11725 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
OtcP11725 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
OtcP11725 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
OtcP11725 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
OtcP11725 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
OtcP11725 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
OtcP11725 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
OtcP11725 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
OtcP11725 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
OtcP11725 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
OtcP11725 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
OtcP11725 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
OtcP11725 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
OtcP11725 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
OtcP11725 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
OtcP11725 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
OtcP11725 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
OtcP11725 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
OtcP11725 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
OtcP11725 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
OtcP11725 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
OtcP11725 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
OtcP11725 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
OtcP11725 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
OtcP11725 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
OtcP11725 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
OtcP11725 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
OtcP11725 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
OtcP11725 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
OtcP11725 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
OtcP11725 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
OtcP11725 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
OtcP11725 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
OtcP11725 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
OtcP11725 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
OtcP11725 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
OtcP11725 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
OtcP11725 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
OtcP11725 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
OtcP11725 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
OtcP11725 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
OtcP11725 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
OtcP11725 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
OtcP11725 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
OtcP11725 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
OtcP11725 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
OtcP11725 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
OtcP11725 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
OtcP11725 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
OtcP11725 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
OtcP11725 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
OtcP11725 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
OtcP11725 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
OtcP11725 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
OtcP11725 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
OtcP11725 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
OtcP11725 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
OtcP11725 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
OtcP11725 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
OtcP11725 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
OtcP11725 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
OtcP11725 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
OtcP11725 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
OtcP11725 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
OtcP11725 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
OtcP11725 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
OtcP11725 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
OtcP11725 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
OtcP11725 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
OtcP11725 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
OtcP11725 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
OtcP11725 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
OtcP11725 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms