Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hoxd4P10628 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hoxd4P10628 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hoxd4P10628 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hoxd4P10628 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hoxd4P10628 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hoxd4P10628 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Hoxd4P10628 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hoxd4P10628 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hoxd4P10628 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hoxd4P10628 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hoxd4P10628 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hoxd4P10628 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hoxd4P10628 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hoxd4P10628 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hoxd4P10628 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hoxd4P10628 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Hoxd4P10628 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hoxd4P10628 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hoxd4P10628 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hoxd4P10628 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hoxd4P10628 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hoxd4P10628 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hoxd4P10628 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hoxd4P10628 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hoxd4P10628 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hoxd4P10628 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hoxd4P10628 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hoxd4P10628 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hoxd4P10628 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hoxd4P10628 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hoxd4P10628 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hoxd4P10628 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hoxd4P10628 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hoxd4P10628 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hoxd4P10628 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hoxd4P10628 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hoxd4P10628 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hoxd4P10628 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hoxd4P10628 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hoxd4P10628 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hoxd4P10628 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hoxd4P10628 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hoxd4P10628 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hoxd4P10628 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Hoxd4P10628 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Hoxd4P10628 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Hoxd4P10628 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hoxd4P10628 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hoxd4P10628 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hoxd4P10628 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hoxd4P10628 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hoxd4P10628 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hoxd4P10628 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hoxd4P10628 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hoxd4P10628 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hoxd4P10628 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hoxd4P10628 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hoxd4P10628 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hoxd4P10628 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hoxd4P10628 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hoxd4P10628 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hoxd4P10628 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hoxd4P10628 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hoxd4P10628 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hoxd4P10628 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hoxd4P10628 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hoxd4P10628 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hoxd4P10628 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hoxd4P10628 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hoxd4P10628 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Hoxd4P10628 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Hoxd4P10628 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Hoxd4P10628 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hoxd4P10628 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hoxd4P10628 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hoxd4P10628 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hoxd4P10628 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hoxd4P10628 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hoxd4P10628 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hoxd4P10628 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hoxd4P10628 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hoxd4P10628 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hoxd4P10628 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hoxd4P10628 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hoxd4P10628 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hoxd4P10628 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hoxd4P10628 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hoxd4P10628 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hoxd4P10628 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hoxd4P10628 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hoxd4P10628 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Hoxd4P10628 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hoxd4P10628 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hoxd4P10628 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hoxd4P10628 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hoxd4P10628 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hoxd4P10628 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hoxd4P10628 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Hoxd4P10628 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms