Protein–RNA interactions for Protein: P0C871

Pla2g4b, Cytosolic phospholipase A2 beta, mousemouse

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pla2g4bP0C871 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Pla2g4bP0C871 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Pla2g4bP0C871 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Pla2g4bP0C871 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Pla2g4bP0C871 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Pla2g4bP0C871 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Pla2g4bP0C871 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Pla2g4bP0C871 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Pla2g4bP0C871 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Pla2g4bP0C871 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Pla2g4bP0C871 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Pla2g4bP0C871 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Pla2g4bP0C871 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Pla2g4bP0C871 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Pla2g4bP0C871 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Pla2g4bP0C871 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Pla2g4bP0C871 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Pla2g4bP0C871 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Pla2g4bP0C871 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Pla2g4bP0C871 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Pla2g4bP0C871 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Pla2g4bP0C871 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Pla2g4bP0C871 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Pla2g4bP0C871 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Pla2g4bP0C871 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Pla2g4bP0C871 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Pla2g4bP0C871 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Pla2g4bP0C871 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Pla2g4bP0C871 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Pla2g4bP0C871 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Pla2g4bP0C871 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Pla2g4bP0C871 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Pla2g4bP0C871 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Pla2g4bP0C871 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Pla2g4bP0C871 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Pla2g4bP0C871 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Pla2g4bP0C871 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Pla2g4bP0C871 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Pla2g4bP0C871 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Pla2g4bP0C871 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Pla2g4bP0C871 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Pla2g4bP0C871 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Pla2g4bP0C871 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Pla2g4bP0C871 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Pla2g4bP0C871 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Pla2g4bP0C871 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Pla2g4bP0C871 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Pla2g4bP0C871 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Pla2g4bP0C871 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Pla2g4bP0C871 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Pla2g4bP0C871 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Pla2g4bP0C871 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Pla2g4bP0C871 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Pla2g4bP0C871 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Pla2g4bP0C871 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Pla2g4bP0C871 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Pla2g4bP0C871 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Pla2g4bP0C871 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Pla2g4bP0C871 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Pla2g4bP0C871 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Pla2g4bP0C871 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Pla2g4bP0C871 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Pla2g4bP0C871 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Pla2g4bP0C871 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Pla2g4bP0C871 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Pla2g4bP0C871 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Pla2g4bP0C871 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Pla2g4bP0C871 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Pla2g4bP0C871 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Pla2g4bP0C871 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Pla2g4bP0C871 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Pla2g4bP0C871 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Pla2g4bP0C871 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Pla2g4bP0C871 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Pla2g4bP0C871 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Pla2g4bP0C871 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Pla2g4bP0C871 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Pla2g4bP0C871 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Pla2g4bP0C871 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Pla2g4bP0C871 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Pla2g4bP0C871 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Pla2g4bP0C871 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Pla2g4bP0C871 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Pla2g4bP0C871 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Pla2g4bP0C871 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Pla2g4bP0C871 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Pla2g4bP0C871 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Pla2g4bP0C871 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Pla2g4bP0C871 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Pla2g4bP0C871 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Pla2g4bP0C871 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Pla2g4bP0C871 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Pla2g4bP0C871 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Pla2g4bP0C871 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Pla2g4bP0C871 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Pla2g4bP0C871 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Pla2g4bP0C871 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Pla2g4bP0C871 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Pla2g4bP0C871 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Pla2g4bP0C871 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms