Protein–RNA interactions for Protein: P06683

C9, Complement component C9, mousemouse

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9P06683 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C9P06683 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
C9P06683 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C9P06683 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C9P06683 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C9P06683 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C9P06683 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C9P06683 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C9P06683 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C9P06683 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C9P06683 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C9P06683 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C9P06683 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C9P06683 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C9P06683 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C9P06683 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
C9P06683 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C9P06683 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
C9P06683 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
C9P06683 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
C9P06683 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C9P06683 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C9P06683 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C9P06683 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C9P06683 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C9P06683 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C9P06683 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
C9P06683 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C9P06683 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
C9P06683 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
C9P06683 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C9P06683 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C9P06683 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C9P06683 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C9P06683 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
C9P06683 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C9P06683 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C9P06683 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C9P06683 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
C9P06683 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C9P06683 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
C9P06683 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
C9P06683 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C9P06683 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C9P06683 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
C9P06683 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
C9P06683 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
C9P06683 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
C9P06683 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C9P06683 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
C9P06683 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
C9P06683 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
C9P06683 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
C9P06683 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
C9P06683 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
C9P06683 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
C9P06683 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C9P06683 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
C9P06683 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C9P06683 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
C9P06683 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
C9P06683 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
C9P06683 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
C9P06683 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
C9P06683 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
C9P06683 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
C9P06683 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
C9P06683 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
C9P06683 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
C9P06683 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
C9P06683 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
C9P06683 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
C9P06683 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
C9P06683 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
C9P06683 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
C9P06683 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
C9P06683 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
C9P06683 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
C9P06683 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
C9P06683 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
C9P06683 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
C9P06683 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
C9P06683 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
C9P06683 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
C9P06683 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
C9P06683 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
C9P06683 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
C9P06683 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
C9P06683 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
C9P06683 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
C9P06683 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
C9P06683 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
C9P06683 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
C9P06683 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
C9P06683 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
C9P06683 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
C9P06683 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
C9P06683 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
C9P06683 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
C9P06683 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms