Protein–RNA interactions for Protein: O88396

Grpel2, GrpE protein homolog 2, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grpel2O88396 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Grpel2O88396 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Grpel2O88396 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Grpel2O88396 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Grpel2O88396 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Grpel2O88396 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Grpel2O88396 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Grpel2O88396 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Grpel2O88396 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Grpel2O88396 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Grpel2O88396 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Grpel2O88396 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Grpel2O88396 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Grpel2O88396 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Grpel2O88396 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Grpel2O88396 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Grpel2O88396 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Grpel2O88396 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Grpel2O88396 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Grpel2O88396 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Grpel2O88396 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Grpel2O88396 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Grpel2O88396 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Grpel2O88396 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Grpel2O88396 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Grpel2O88396 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Grpel2O88396 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Grpel2O88396 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Grpel2O88396 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Grpel2O88396 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Grpel2O88396 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Grpel2O88396 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Grpel2O88396 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Grpel2O88396 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Grpel2O88396 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Grpel2O88396 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Grpel2O88396 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Grpel2O88396 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Grpel2O88396 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Grpel2O88396 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Grpel2O88396 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Grpel2O88396 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Grpel2O88396 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Grpel2O88396 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Grpel2O88396 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Grpel2O88396 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Grpel2O88396 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Grpel2O88396 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Grpel2O88396 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Grpel2O88396 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Grpel2O88396 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Grpel2O88396 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Grpel2O88396 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Grpel2O88396 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Grpel2O88396 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Grpel2O88396 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Grpel2O88396 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Grpel2O88396 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Grpel2O88396 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Grpel2O88396 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Grpel2O88396 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Grpel2O88396 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Grpel2O88396 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Grpel2O88396 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Grpel2O88396 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Grpel2O88396 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Grpel2O88396 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Grpel2O88396 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Grpel2O88396 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Grpel2O88396 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Grpel2O88396 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Grpel2O88396 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Grpel2O88396 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Grpel2O88396 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Grpel2O88396 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Grpel2O88396 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Grpel2O88396 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Grpel2O88396 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Grpel2O88396 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Grpel2O88396 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Grpel2O88396 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Grpel2O88396 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Grpel2O88396 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Grpel2O88396 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Grpel2O88396 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Grpel2O88396 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Grpel2O88396 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Grpel2O88396 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Grpel2O88396 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Grpel2O88396 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Grpel2O88396 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Grpel2O88396 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.77■■□□□ 1.23
Grpel2O88396 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Grpel2O88396 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Grpel2O88396 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Grpel2O88396 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Grpel2O88396 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Grpel2O88396 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Grpel2O88396 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Grpel2O88396 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms